Identification of proteins involved in the posttranscriptional regulation of expression of tobacco (Nicotiana tabacum) male gametophyte-specific genes
Project goals
Male gemetophyte presents a natural system for the study of the gene expression on the post-transcriptional level. In growing pollen tubes where transcription has already stopped, intensive translational activity is still growth-limiting, based on mRNA that was preformed in earlier stages of pollen grain development and stored in translationally inactive state up to now. The aim of this proposal is to prove the existence of stored mRNP particles and to analyze the proteins that are engaged in mRNA repression. The Ntp303 gene, transcribed and stored in immature bovacco pollen and translated exclusively during pollen tube growth, appears to be a useful marker. Temporal and spatial distribution of Ntp303 mRNA and following analyses should contribute to the understanding of the mechanism of the regulation of translation. Polysomes and mRNP particles will be isolated and both mRNAs and proteins of both fractions will be analysed taking advantage of Northwestern assay, affinity and gel chromatography.
Keywords
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
—
Main participants
Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
Contest type
—
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Identifikace bílkovin účastnících se posttranskripční regulace exprese genů v samčím gametofytu tabáku (Nicotiana tabacum)
Annotation in Czech
Samčí gemetofyt je přirozený modelový systém pro studium postgranskripční regulace exprese genů. V rostoucích pylových láčkách je transkripce již ukončena, ale jejich růst je zcela závislý na intensivní translaci. V pylových láčkách je pro translaci využívána mRNA, která je syntetizována v průběhu vývoje a zrání pylových zrn a uskladněna v netraslatovatelném stavu. Cílem práce je prokázat existenci skladovaných mRNP částic a analyzovat bílkoviny podílející se na jejich represi. Hlavním markerem pro většinu analýz bude gen Ntp303, přepisovaný a skladovaný v nezralém pylu, a překládaný až v rostoucích pylových láčkách. Časová a prostorová distribuce Ntp303-mRNA a následné analýzy by měly přispět k pochopení mechanismu translační regulace. Budou separována frakce polysomů a mRNP částic, budou analyzovány mRNA a bílkoviny těchto frakcí. Bude využita Northwesternová analýza, afinitní a gelová chromatografie a všechny typy elektroforetického rozdělení bílkovin.
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Pylově specif. ntp303 transkripty se během zrání tabák. pylu intenzivně syntetizují, ukládají a vytvářejí komplexy mRNP částic. p30 kDa je zřejmě mRNA-vaz. bílkovinou zodpovědnou za netranslatovatel. a rezis. těchto komplexů vůči polysomy destab. látkám.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 1998
Realization period - end
Jan 1, 2000
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2001/AV0/AV01IA/U/N/4:2
Data delivery date
—
Finance
Total approved costs
4,671 thou. CZK
Public financial support
1,702 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
4 671 CZK thou.
Public support
1 702 CZK thou.
36%
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
CEP
EB - Genetics and molecular biology
Solution period
01. 01. 1998 - 01. 01. 2000