Phylogenetic relationships in the family Bovidae studied by analysis of subfamily specific DNA repeats and karyotype
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 13 (SGA02010GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P506-10-0421
Alternative language
Project name in Czech
Fylogenetické vztahy v rámci čeledi Bovidae definované na základě analýzy karyotypu a podčeleďově specifických satelitních DNA
Annotation in Czech
Repetitivní DNA sekvence přítomné v (peri) centromerickém a genomovém heterochromatinu představují evolučně rychle se vyvíjející složku genomu a byly dosud s úspěchem použity v několika studiích jako fylogenetický marker. V předkládaném grantu budou na základě analýzy podčeleďově specifických satelitních DNA studovány evoluční a fylogenetické vztahy velmi rozsáhlé a různorodé čeledi Bovidae. Bude stanoven a pomocí komparativní FISH s bovinními celochromosomovými sondami ověřen karyotyp všech vyšetřovaných druhů. Podčeleďově specifické DNA sekvence izolované z pohlavních chromosomů a centromer autosomů budou získávány pomocí technik laserové mikrodisekce, DOP-PCR, klonování, inverzní PCR a sekvenování. Na základě analýzy karyotypu, srovnání homologií amezidruhových hybridizací (FISH) sledovaných sekvencí budou specifikovány evoluční a fylogenetické vztahy mezi vyšetřovanými druhy a zkoumán vývoj pohlavních chromosomů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EG - Zoology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10613 - Zoology<br>10614 - Behavioral sciences biology<br>10615 - Ornithology<br>10616 - Entomology<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
According to proposal, karyotype evolution (incl. sex chromosome evolution) was studied in the family Bovidae using FISH and chromosomal painting. New karyological data on non-domesticated taxa of the family Bovidae were estimated. The role of interspecific hybridization in the family evolution was evaluated. Results published in 7 papers in journals indexed in WoS.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2010
Realization period - end
Dec 31, 2013
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jun 7, 2013
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP14-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jul 1, 2014
Finance
Total approved costs
4,059 thou. CZK
Public financial support
3,634 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK