The use of molecular cytogenetics for evolutionary and taxonomic studies among Cervidae
Project goals
The family Cervidae groups together species with a growing economic potential and endangered species. Karyotypes and phylogenetic position of many deer species are uncertain due to the lack of detailed scientific data. The extensive variation in chromosome numbers (2n=6-70) and structure makes this family suited for evolutionary studies based on interspecies molecular cytogenetic comparisons. In this project, we will perform a comparative analysis in a wide range of deer species, focusing on species lacking comprehensive data, including the genus Mazama and its cytotypes. We will determine karyotype differences and their impact on production of aneuploid spermatozoa and reproductive isolation, identify intrachromosomal rearrangements of the X chromosomes, and compare sequence similarities and chromosomal positions of satellite DNAs in various deer species. For this purpose, whole chromosome, BAC and satellite DNA probes for FISH will be constructed in VRI laboratory. Obtained data will be used to improve taxonomic classification, and review phylogenetic relationships within Cervidae.
Keywords
CervidaeMazamacomparative cytogeneticskaryotypesatellite DNAX chromosomespermatozoaFISH
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
International projects
Call for proposals
SGA0202000003
Main participants
Výzkumný ústav veterinárního lékařství, v.v.i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
20-22517J
Alternative language
Project name in Czech
Využití molekulární cytogenetiky v evolučních a taxonomických studiích u Cervidae
Annotation in Czech
Čeleď Cervidae (jelenovití) sdružuje druhy s rostoucím ekonomickým potenciálem a ohrožené druhy. Karyotypy a fylogenetická pozice řady druhů jelenovitých jsou dosud nejasné kvůli nedostatku detailních vědeckých informací. Rozsáhlá variabilita počtu (2n=6-70) a struktury chromosomů činí tuto čeleď vhodnou pro studium evoluce založené na mezidruhových molekulárně cytogenetických srovnáních. V tomto projektu plánujeme provést komparativní analýzu širokého spektra druhů, zaměřenou především na málo prostudované druhy, včetně rodu Mazama a jeho cytotypů. Budou stanoveny karyotypové rozdíly a jejich vliv na produkci aneuploidních spermií a reprodukční izolaci, identifikovány intrachromosomové přestavby chromosomu X a srovnány sekvence a chromosomální pozice satelitních DNA u různých druhů Jelenovitých. Za tímto účelem budou v laboratoři VUVeL připraveny FISH sondy pro celé chromosomy a jejich části, BAC a satelitní sondy. Získaná data budou využita ke zpřesnění taxonomické klasifikace a přehodnocení fylogenetických vztahů v rámci Cervidae.
Scientific branches
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Among important results of the project is establishment of the homology between bovine and deer chromosomes, description of a new deer species which is important for the biodiversity protection.
Solution timeline
Realization period - beginning
May 1, 2020
Realization period - end
Dec 31, 2021
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 30, 2021
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP22-GA0-GC-U
Data delivery date
Jun 29, 2022
Finance
Total approved costs
4,215 thou. CZK
Public financial support
4,215 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
4 215 CZK thou.
Public support
4 215 CZK thou.
100%
Provider
Czech Science Foundation
OECD FORD
Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Solution period
01. 05. 2020 - 31. 12. 2021