Adaptive genomic divergence to climatic refugia
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 14 (SGA02011GA-ST)
Main participants
Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P506-11-1872
Alternative language
Project name in Czech
Adaptivní genomová divergence v klimatických refugiích
Annotation in Czech
Naše znalosti adaptivní odpovědi organismů na klimatické změny jsou stále velmi omezené, jak co se týká fyziologických změn, tak i evolučních procesů, které k nim vedou. Identifikování genů odpovědných za fyziologické vlastnosti, které umožnily druhům mírného pásma tolerovat vrcholně glaciální podmínky v severních refugiích, může mít skutečný význam pro naše porozumění adaptivní odpovědi na klimatické změny. Navrhujeme proto použít nové techniky založené na masivně paralelním sekvenování k prohledání tisíců různých genů v genomu norníka rudého, Myodes glareolus, s cílem identifikovat ty geny se vztahem k fyziologické toleranci, které umožnili norníkům v severních refugiích přežít během posledního glaciálního maxima dále na severu než ostatní populace tohoto druhu. Získaní těchto znalostí o norníkovi nám umožní formulovat obecnější hypotézy o přežívání organismů mimo jejich typické klimatické zóny.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EG - Zoology
CEP - secondary branch
EH - Ecology - communities
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10613 - Zoology<br>10614 - Behavioral sciences biology<br>10615 - Ornithology<br>10616 - Entomology<br>10618 - Ecology<br>10619 - Biodiversity conservation<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Highly successful project that led to the publication of five impacted papers in high-ranked journals, two diploma theses and one popularization article. In all papers, the PI is either the first or corresponding author that highlights the critical contribution of the team. Financial management followed CSF rules.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2011
Realization period - end
Dec 31, 2015
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 26, 2015
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP16-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Sep 25, 2017
Finance
Total approved costs
10,801 thou. CZK
Public financial support
10,801 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK