Evolutionary ecology, taxonomy and secondary metabolites of the genus Geosmithia
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 14 (SGA02011GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P506-11-2302
Alternative language
Project name in Czech
Evoluční ekologie, taxonomie a sekundární metabolity rodu Geosmithia
Annotation in Czech
Rod Geosmithia zahrnuje málo známé symbionty kůrovců. Některé z těchto hub žijí v symbioze s lesnicky významnými parazity či jsou přímo fytopatogenní. Rod Geosmithia je díky své taxonomické i ekologické diverzitě vynikajícím modelem pro studium evolučníekologie hub žijících v symbióze s podkorním hmyzem a vzniku ambrosiových hub. Komplexní rekonstrukce evoluce celé skupiny, včetně poznání toho jak a proč k ní docházelo a jaké adaptivní změny ji provázely, bude provedena na základě informací o příbuznosti geosmithií, areálu výskytu, hostitelské specificitě, ekologii vektoru, a dále o fyziologických vlastnostech (enzymatické aktivity, zdroje C, N, P, S), biochemickém složení buněk (obsah DNA, ergosterolu a mastných kyselin) a spektru sekundárních metabolitů (UPLC-MS fingerprinting). Informace o obsahu DNA (měřené pomocí průtokové cytometrie) by mohla osvětlit proces náhlé speciace vedoucí ke vzniku velkosporých ambrosiových druhů. Výsledkem práce bude dále taxonomická revize rodu, studie použití UPLC-fingerprintingu u hub a poznání sekundárních metabolitů s možným biotechnologickým potenciálem.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EF - Botany
CEP - secondary branch
EE - Microbiology, virology
CEP - another secondary branch
CB - Analytical chemistry, separation
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10406 - Analytical chemistry<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
According to the proposal, phylogeny, host range, enzymatic activity, secondary metabolite profiles and genome size have been studied in parasitic fungal genus Geosmithia associated with bark beetles. New compounds with potentially anticancer activity were identified. 3 papers in journals indexed in WoS have been published (+ 2 accepted / 3 submitted / 3 Ms./PhD. theses defended).
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2011
Realization period - end
Dec 31, 2013
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jun 12, 2013
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP14-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jul 1, 2014
Finance
Total approved costs
5,608 thou. CZK
Public financial support
5,608 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK