Structural and functional analysis of regulation of the lipid-transport protein ORP8
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
—
Call for proposals
—
Main participants
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Contest type
M2 - International cooperation
Contract ID
21-27735K
Alternative language
Project name in Czech
Strukturní a funkční analýza regulace lipid-transportního proteinu ORP8
Annotation in Czech
Vnitrobuněčný transport lipidů mezi různými membránami probíhá buď pomocí dobře popsaného vesikulárního transportu, nebo ho zprostředkovávají speciální proteiny z rodiny lipidových transportérů. ORPs (z anglického "OSBP-related proteins") přenášejí lipidy na kontaktních místech membrán, např. mezi endoplazmatickým retikulem (ER) a plasmatickou membránou (PM). Takto zajišťují transport lipidu z místa jeho syntézy (ER) do cílové membrány (např. PM, Golgi nebo mitochonrie). Tím udržují správné složení membrán a proto také musí být přesně regulovány. Vybrali jsme si protein ORP8 jako reprezentativního zástupce této rodiny, protože má typické doménové složení a dobře se produkuje rekombinantně v množstvích potřebných pro strukturní analýzu. Náš celkový cíl je získat atomový model transportu lipidů z donorové do akceptorové membrány pomocí ORP proteinů. K dosažení cíle plánujeme kombinovat několik biofyzikálních metod: rentgenovou strukturní analýzu, rozptyl paprsků X (SAXS), Försterův rezonanční přenos energie na jednotlivých molekulách (smFRET) a molekulárně-dynamické simulace.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2021
Realization period - end
Dec 31, 2023
Project status
—
Latest support payment
Mar 2, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-GA0-GF-R
Data delivery date
May 21, 2024
Finance
Total approved costs
4,220 thou. CZK
Public financial support
3,260 thou. CZK
Other public sources
861 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK