Molecular and functional analysis of the nucleolus in 3D genome organization during early embryo development
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
—
Call for proposals
—
Main participants
Ústav experimentální medicíny AV ČR, v. v. i.
Contest type
M2 - International cooperation
Contract ID
22-02610K
Alternative language
Project name in Czech
Molekulární a funkční analýza vlivu jadérka na 3D organizaci genomu během časného embryonálního vývoje
Annotation in Czech
Genom eukaryot vykazuje komplexní 3D uspořádání, o němž se předpokládá, že ovlivňuje správnou expresi genů. Cílem tohoto projektu je objasnit roli jadérka ve funkční organizaci genomu během časného embryonálního vývoje a při ustanovení totipotence, které je doprovázeno rozsáhlou epigenetickou i strukturální remodelací rodičovských genomů po oplození. Jak se jadérko, které spolu s periferií funguje jako hlavní jaderná organizační struktura, podílí na zajištění správného vývojového programu, není zcela známé. K dosažení tohoto cíle použijeme „multi-omics“ přístup. Důraz bude kladen převedším na zcela novou technologii „nucleolar-DamID“ umožňující identifikaci genomických domén, které jsou s jadérkem v kontaktu. Navozením ektopické asociace vybraných sekvencí pomocí technologie založené na CRISPR/Cas9 provedeme funkční testování role jadérek v 3D organizaci genomu a v exekuci správného vývojového programu. Tyto výsledky nejen že zásadně rozšíří naše znalosti o molekulární podstatě vývoje, ale z hlediska embryobiotechnologií přinesou i aplikovatelné a klinicky relevantní informace.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Mar 1, 2022
Realization period - end
Dec 31, 2025
Project status
B - Running multi-year project
Latest support payment
Mar 2, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-GA0-GF-R
Data delivery date
Feb 19, 2024
Finance
Total approved costs
7,289 thou. CZK
Public financial support
7,289 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK