Structure, biology and medical potential of blood plasma-derived ultra-short cell-free DNA
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
—
Call for proposals
—
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
M2 - International cooperation
Contract ID
22-04242L
Alternative language
Project name in Czech
Struktura, biologie a medicínský potenciál ultra-krátké mimobuněčné DNA v krevní plasmě
Annotation in Czech
Při programované buněčné smrti dochází k uvolňování fragmentů DNA. Fragmentace uvolněné mimobuněčné DNA (mDNA) v krevní plazmě odráží tkáňový původ mDNA a mechanismus jejího uvolnění. V rámci předběžné studie jsme ustanovili nový protokol pro izolaci mDNA, který nám umožnil zachytit jedno-řetězcové ultra-krátké fragmenty mDNA (UK mDNA, ~50 nt) z krevní plazmy. Zjistili jsme, že UK mDNA má svůj původ v promotorových oblastech genů majících přístupné transkripční startovací místa. Naše předběžná data ukazují, že výskyt UK mDNA fragmentu v krevní plasmě je velmi silně korelován s její schopností tvořit nekanonické DNA struktury (G-quadruplex a i-motif). Naše data ukázaly, že krevní plazma ze zdravých jednotlivců má podstatně větší populace UK mDNA než plazma rakovinných pacientů. Toto pozorovaní naznačuje, že UK mDNA má specifickou a dosud neznámou roli ve fyziologii rakoviny. Pochopení metabolismu, biogeneze, a struktury UK mDNA může pomoci k pochopení její biologické role a umožnit vývoj nových diagnostických, popř. terapeutických, přístupů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
30204 - Oncology
OECD FORD - secondary branch
30205 - Hematology
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
FD - Oncology and haematology
Solution timeline
Realization period - beginning
Oct 1, 2022
Realization period - end
Dec 31, 2025
Project status
K - Ending multi-year project
Latest support payment
Jul 3, 2024
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-GA0-GF-R
Data delivery date
Mar 14, 2025
Finance
Total approved costs
10,272 thou. CZK
Public financial support
9,732 thou. CZK
Other public sources
540 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK