Novel anti-Stokes lanthanide nanoparticles and multicolor FRET mechanisms for single-molecule DNA sequencing
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
—
Call for proposals
—
Main participants
Masarykova univerzita / Přírodovědecká fakulta
Contest type
M2 - International cooperation
Contract ID
23-06199K
Alternative language
Project name in Czech
Nové anti-Stokesové lanthanoidové nanočástice a vícebarevný FRET mechanismy pro jednomolekulové sekvenování DNA
Annotation in Czech
Sekvenování DNA je klíčovou technologií pro vědy o živé přírodě vědy a klinickou diagnostiku, protože umožňuje včasné individuální posouzení rizik různých onemocnění (např. rakoviny), která mají genetickou složku. Ačkoli existuje několik metod sekvenování DNA, detekce aktivity jedné molekuly DNA polymerázy fluorescenční mikroskopií je vědecky a technicky náročná, protože při začlenění jednoho ze čtyř fluorescenčně značených deoxyribonukleotidů vzniká pouze velmi slabý signál. Naším cílem je vyvinout nový systém vícebarevného rezonančního přenosu energie (FRET) založený na nanočásticích, což v kombinaci s jednotlivými molekulami DNA polymerázy ("nanočtečky" DNA) umožní číst sekvence DNA kontinuálně, přesně a paralelně. Tento interdisciplinární projekt bude zahrnovat vývoj nové instrumentace, nových anti-Stokesových luminiscenčních nanomateriálů pro vícebarevný FRET, které lze detekovat bez autofluorescence, a jejich biofunkcionalizace k překonání zásadních omezení nejmodernějších technik sekvenování DNA.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])
OECD FORD - secondary branch
21001 - Nano-materials (production and properties)
OECD FORD - another secondary branch
21002 - Nano-processes (applications on nano-scale); (biomaterials to be 2.9)
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EI - Biotechnology and bionics<br>JJ - Other materials
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2023
Realization period - end
Dec 31, 2025
Project status
K - Ending multi-year project
Latest support payment
Feb 29, 2024
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-GA0-GF-R
Data delivery date
Mar 24, 2025
Finance
Total approved costs
6,525 thou. CZK
Public financial support
6,525 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK