Stop codon readthrough lessons from the tRNA anti-codon stem.
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
—
Call for proposals
—
Main participants
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
M2 - International cooperation
Contract ID
23-08669L
Alternative language
Project name in Czech
Lekce antikodonového kmene tRNA z pročítání stop kodónu.
Annotation in Czech
Pokud si gen představíte jako větu začínající velkým písmenem a končící tečkou a genom jako knihu vyprávějící celý příběh, nedávno se ukázalo, že existují specifické organismy, do jejichž vět pronikly tečky navíc. V důsledku toho jsou čtenáři (v tomto případě ribozomy) zmateni, kde tyto věty skutečně končí, a příběh se stává nesouvislým. Objevili jsme molekulární mechanismus, který se u těchto organismů musel vyvinout, aby čtenáři/ribozomy mohli procházet jejich větami, jako by v nich žádné tečky navíc nebyly. Věty jsou tak specificky zašifrované, že čtenáři/ribozomy žádných jiných organismů, kromě těchto několika málo, nedokážou příběh správně rozluštit. Trik spočívá ve změně složení a/nebo délky „anti-codon stem-u“ u tRNA s přirozeným sklonem indukovat pročítání stop kodónů, a také ve specifických mutacích „release“ faktorů. Objevili jsme, že tyto triky se uplatňují i při programovaném pročítání stop kodonů u všech organismů. Zde, v rámci trojstranné spolupráce, podrobíme tyto kritické hráče detailní analýze a pokusíme se vyřešit strukturu ribozomu, který právě pročítá stop kodon.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10606 - Microbiology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EE - Microbiology, virology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jul 1, 2023
Realization period - end
Dec 31, 2026
Project status
B - Running multi-year project
Latest support payment
Sep 13, 2023
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-GA0-GF-R
Data delivery date
Feb 19, 2024
Finance
Total approved costs
17,968 thou. CZK
Public financial support
17,968 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK