Stop codon readthrough lessons from the tRNA anti-codon stem.

Provider

Czech Science Foundation

Programme

—

Call for proposals

—

Main participants

Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.

Contest type

M2 - International cooperation

Contract ID

23-08669L

Project name in Czech

Lekce antikodonového kmene tRNA z pročítání stop kodónu.

Annotation in Czech

Pokud si gen představíte jako větu začínající velkým písmenem a končící tečkou a genom jako knihu vyprávějící celý příběh, nedávno se ukázalo, že existují specifické organismy, do jejichž vět pronikly tečky navíc. V důsledku toho jsou čtenáři (v tomto případě ribozomy) zmateni, kde tyto věty skutečně končí, a příběh se stává nesouvislým. Objevili jsme molekulární mechanismus, který se u těchto organismů musel vyvinout, aby čtenáři/ribozomy mohli procházet jejich větami, jako by v nich žádné tečky navíc nebyly. Věty jsou tak specificky zašifrované, že čtenáři/ribozomy žádných jiných organismů, kromě těchto několika málo, nedokážou příběh správně rozluštit. Trik spočívá ve změně složení a/nebo délky „anti-codon stem-u“ u tRNA s přirozeným sklonem indukovat pročítání stop kodónů, a také ve specifických mutacích „release“ faktorů. Objevili jsme, že tyto triky se uplatňují i při programovaném pročítání stop kodonů u všech organismů. Zde, v rámci trojstranné spolupráce, podrobíme tyto kritické hráče detailní analýze a pokusíme se vyřešit strukturu ribozomu, který právě pročítá stop kodon.

R&D category

ZV - Basic research

OECD FORD - main branch

10606 - Microbiology

OECD FORD - secondary branch

—

OECD FORD - another secondary branch

—

CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

EE - Microbiology, virology

Realization period - beginning

Jul 1, 2023

Realization period - end

Dec 31, 2026

Project status

Z - Beginning multi-year project

Latest support payment

—

Confidentiality

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Data delivery code

CEP23-GA0-GF-R

Data delivery date

Sep 4, 2023

Total approved costs

18,080 thou. CZK

Public financial support

18,080 thou. CZK

Other public sources

0 thou. CZK

Non public and foreign sources

0 thou. CZK