Dynamic polymorphism of non-canonical nucleic acids structures in the intracellular space
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
—
Call for proposals
—
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
M2 - International cooperation
Contract ID
24-10605K
Alternative language
Project name in Czech
Dynamický polymorfismus nekanonických strukturních motivů nukleových kyselin ve vnitrobuněčném prostoru
Annotation in Czech
Dynamické přechody mezi B-DNA a tetraplexovými strukturami DNA, zejména DNA G-kvadruplexy a i-motivy, se podílý na regulační kontrole integrity genomu a exprese genů. Tvorba G-kvadruplexů v RNA naopak přispívá k regulaci biologické stability mRNA. Regulační funkce těchto struktur je svázana s jejich dynamickým polymorfismem: spoluexistence různých konformací je klíčová pro jejich stabilitu a funkci a umožňuje jim citlivě reagovat na změny ve fyzikálně-chemických vlastnostech vnitrobuněčného prostředí v důsledku buněčného stresu a těch vycházejících z přirozených, fyziologických oscilací. Přenos informace o změně parametrů prostředí do dynamických rovnovách těchto struktur tak představuje autonomní signální kaskádu. Dosud byla strukturní charakterizace nekanonického polymorfismu NA založena na biofyzikálních experimentech za podmínek in vitro. Nicméně tyto studie neumožňují zachycení komplexních vztahů mezi dynamickými strukturálními rovnováhami a vnitrobuněčným prostředím specifickými pro rozdílné fyziologické stavy.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10609 - Biochemical research methods
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jul 1, 2024
Realization period - end
Dec 31, 2027
Project status
Z - Beginning multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP24-GA0-GF-R
Data delivery date
Jun 11, 2024
Finance
Total approved costs
10,419 thou. CZK
Public financial support
10,203 thou. CZK
Other public sources
216 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK