Mapping RNP-NUP interactions during nuclear export
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
—
Call for proposals
—
Main participants
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Contest type
M2 - International cooperation
Contract ID
25-18648L
Alternative language
Project name in Czech
Mapování interakcí RNP-NUP během jaderného exportu
Annotation in Czech
Kompartmentalizace dědičné informace v buněčném jádře nutně vedla ke vzniku transportní brány, která umožní průchod ribonukleoproteinů (RNP) skrz jaderný obal. Současný pohled se odklání od představy jednoduchého jaderného póru (JP) směrem ke komplexní transportní platformě. Cílem práce bylo lépe popsat JP T. brucei, která představuje evolučně starý eukaryotický organismus. Podařilo se nám vyvinout set spolehlivých metod pro zmapování interakce nukleoporinu s transportovaným nákladem a identifikovat mechanismus jejich importu a exportu. Námi vyvinutá kombinace proximálního značení a expanzní mikroskopie umožnila najít asymetrické skupiny řídící transport a odhalit nové komponenty JP, pomocí nichž bude možné získat přesnější model JP trypanozom. Náš přístup odhalil nové komponenty asociované s JP včetně jejich pozice, které nyní využijeme k prozkoumání adaptací jaderného koše trypanosom, jejich řízení exportu a přestavbu mRNP. Získané poznatky budou využity nejen k objasnění evoluce JP, umožní také odhalit procesy potenciálně vhodné jako cíle pro léčbu infekcí trypanosomami
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Oct 1, 2025
Realization period - end
Dec 31, 2028
Project status
Z - Beginning multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-GA0-GF-R
Data delivery date
Oct 9, 2025
Finance
Total approved costs
8,124 thou. CZK
Public financial support
8,124 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK