Development of Reliable Methods for Automated Quantitative Characterization of Cell Motility in Fluorescence Microscopy
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Junior Grants
Call for proposals
Juniorské granty 2 (SGA0201600002)
Main participants
Masarykova univerzita / Fakulta informatiky
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
16-03909Y
Alternative language
Project name in Czech
Vývoj spolehlivých metod pro automatizovanou kvantitativní charakterizaci buněčné motility ve fluorescenční mikroskopii
Annotation in Czech
Biomedicínský výzkum zaměřený na pochopení mechanismů buněčné motility a její regulace v nádorových buňkách generuje pomocí plně automatizovaných optických mikroskopů velké množství vícerozměrných obrazových dat, což činí jejich manuální zpracování extrémně časově náročné a velmi náchylné k chybám. Proto jsou požadovány spolehlivé metody analýzy obrazu, umožňující automatickou kvantifikaci těchto obrazových dat. V projektu se zaměříme na vývoj spolehlivých metod analýzy obrazu pro kvantitativní charakterizaci buněčné motility vyvolané buněčnými výčnělky na náběžné hraně pohybujících se buněk. Vyvinuté metody budou ověřeny a jejich možnosti a citlivosti na nastavení parametrů budou studovány na časosběrných, trojrozměrných, fluorescenčních obrazech i obrazech uměle vygenerovaných, které realisticky imitují pohybující se buňky s buněčnými výčnělky, pokrývajících široké spektrum akvizičních a biomechanických podmínek. Tento projekt poskytne informatické nástroje pro lepší pochopení složitého chování pohybujících se buněk v biologických procesech, jakým je například tumorigeneze.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
IN - Informatics
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The goal of the project was developing image analysis methods intended for quantitative characterization of cell motility. Original results were achieved. These results correspond to the project objectives. The results were published in two impacted journals with the contribution of foreign co-operation. The results were also presented at 4 conferences. The objectives of the project were met.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2016
Realization period - end
Dec 31, 2018
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 16, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP19-GA0-GJ-U/01:2
Data delivery date
Jun 11, 2019
Finance
Total approved costs
5,884 thou. CZK
Public financial support
5,884 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK