Development and Study of Methods for Live Cell Quantification
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 18 (SGA0201400001)
Main participants
Masarykova univerzita / Fakulta informatiky
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
14-22461S
Alternative language
Project name in Czech
Vývoj a studium metod pro kvantifikaci živých buněk
Annotation in Czech
Studie živých buněk a jejich interakcí jsou nepostradatelné pro výzkum v oblasti živých věd. Většina dat pro tyto studie je pořizována pomocí plně automatizovaných optických mikroskopů, které produkují tak velké množství obrazů, že je nutná jejich automatická analýza na počítačích. To vyžaduje dobré porozumění nejen chování jednotlivých metod, ale i jejich citlivosti na parametry, a to pro obrazy různých kvalit a pořízených i za ne zcela optimálních podmínek. V projektu budeme generovat realistické umělé obrazy živých buněk a simulovat dynamické procesy uvnitř buněk i mezi buňkami a používat tyto obrazy pro studium chování, limitů a citlivosti na parametry jak existujících tak i nově vyvinutých metod zpracování obrazu. Rovněž budeme studovat vliv zpracování obrazu na výsledky kvantifikace. Výsledky získané pomocí simulovaných dat budou porovnávány s výsledky pro reálné obrazy. Projekt přispěje k porozumění a vývoji metod pro kvantifikaci živých buněk.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
IN - Informatics
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10201 - Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The main gains of the project are: 1. Novel methods for the quantification of dynamic cellular processes in living cells based on optical microscopy images. 2. Tools for generating the images of cell populations. The information provided by the researchers is adequate. The project is important for cell research. The amount and quality of publications is appropriate. Project economy is correct.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2014
Realization period - end
Dec 31, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 5, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-GA0-GA-U/03:1
Data delivery date
Jun 28, 2017
Finance
Total approved costs
4,751 thou. CZK
Public financial support
4,751 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK