Characterization of meiotic recombination regions in bread wheat
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Junior Grants
Call for proposals
Juniorské granty 2 (SGA0201600002)
Main participants
Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
16-07155Y
Alternative language
Project name in Czech
Charakterizace regionů meiotické rekombinace v pšenici seté
Annotation in Czech
Pšenice setá je jednou z nejdůležitějších hospodářských plodin, poskytující základní výživu pro 40% lidské populace. Obohacení genových zdrojů pšenice o geny z příbuzných druhů přispívající ke zvýšení výnosu a odolnosti k biotickým a abiotickým stresům je atraktivní strategií pro zajištění stabilní produkce. Meiotická rekombinace, která přenos genů umožňuje, však není doposud dostatečně prozkoumána. V pšenici je tento proces kontrolován lokusem Ph1. Byly vytvořeny tři mapovací populace, odvozené z introgresní linie nesoucí segmenty T. militinae genomu, které se výrazně liší frekvencí rekombinací v 4A introgresním regionu. Jedna z mapovacích populací nese recesivní alelu pro Ph1 lokus. Vysoko-hustotní mapa a sekvenční charakterizace 15 Mb regionu introgrese na chromosomu 4A jsou ideální základnou pro studium rekombinací na úrovni DNA. V předloženém projektu navrhujeme studovat místa rekombinací na sekvenční a epigenetické úrovni a vliv Ph1 lokusu na jejich výběr.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
O - Nesplněno zadání, smlouva však byla dodržena
Project results evaluation
Due to the premature termination of the project at the beginning of 2017, the results are limited to those achieved in the first year. Two methods using flow-sorted pollen nuclei to study recombination hot-spots - "pollen typing", and digital droplet PCR - were introduced. The region of interest was annotated including identification of 502 of novel genes and pseudogenes.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2016
Realization period - end
Dec 31, 2017
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jan 19, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP18-GA0-GJ-U/02:1
Data delivery date
May 4, 2018
Finance
Total approved costs
2,961 thou. CZK
Public financial support
2,961 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK