Physical map of the wheat chromosome 4AL and positional cloning of a gene for yield
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 13 (SGA02010GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P501-10-1740
Alternative language
Project name in Czech
Fyzická mapa chromozómu 4AL pšenice a poziční klonování genu ovlivňujícího výnos
Annotation in Czech
Pšenice setá je jednou z nejdůležitějších plodin na světě. Rostoucí lidská populace a rychle se měnící přírodní podmínky vyžadují šlechtění nových výnosnějších odrůd. Nejefektivnější způsob šlechtění odrůd s požadovanými vlastnostmi je použití sekvencí genů odpovědných za vybrané znaky jako DNA markery. Tento přístup však vyžaduje identifikaci těchto genů a jejich klonování. V tomto projektu navrhujeme klonovat QTL Qyie-4A-bga pro výnos, který byl nedávno lokalizovaný na chromozómovém rameni 4AL v 50 cMoblasti mezi DNA markery wmc161 a wmc760. Tento QTL je velmi stabilní v širokém rozsahu podmínek a přispívá 5 až 17 % k variabilitě výnosu. S cílem předejít problémům plynoucím z komplexity genomu pšenice bude konstruována fyzická mapa chromozómového ramene chromozómu 4AL. Minimální sestava BAC klonů pokrývajících lokus Qyie-4A-bga bude sekvenována a získané sekvence budou použity pro vývoj nových markerů a identifikaci kandidátních genů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
GE - Plant cultivation
CEP - another secondary branch
EF - Botany
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The main project contribution includes construction of BAC library of 4AL chromosome of wheat and delimitation of position of specific yield QLT from 50 to 3.2 cM. Two original impact articles and two reviews were published in the frame of the project, next three impact articles are in press. The goals of the project were fulfilled. Project was without budget problems.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2010
Realization period - end
Dec 31, 2013
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jun 7, 2013
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP14-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Jul 1, 2014
Finance
Total approved costs
6,880 thou. CZK
Public financial support
6,880 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK