Physical map of wheat chromosome arm 7DS and its use to clone a Russian wheat aphid resistance gene
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 15 (SGA02012GA-ST)
Main participants
Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P501-12-2554
Alternative language
Project name in Czech
Fyzická mapa krátkého ramene chromozómu 7D pšenice a její využití pro klonování genu pro rezistenci k mšici zhoubné
Annotation in Czech
Poziční klonování genů pšenice seté je považováno za velmi náročné vzhledem ke značné velikosti genomu pšenice (~17 Gbp) a jejímu polyploidnímu charakteru. Jedna ze strategií usnadňujících dosažení tohoto cíle je založena na využití genomických materiálů vytvořených pouze z menších částí genomu - chromozómů nebo jejich ramen. V předkládaném projektu navrhujeme sestavení fyzické mapy z klonů BAC knihovny DNA již dříve připravené z krátkého ramene chromozómu 7D pšenice a osekvenování takto uspořádaných klonů technologií Illumina. Získané sekvence umožní ukotvení fyzické mapy na mapu genetickou. Integrovaná mapa a uspořádaná sekvence DNA ramene 7DS výrazně urychlí klonování všech genů nacházejících se v této části genomu pšenice. V rámci projektu předpokládáme poziční klonování genu pro rezistenci k jednomu z nejzávažnějších škůdců pšenice, mšici zhoubné (Diuraphis noxia). Znalost genu pro rezistenci přispěje k odhalení molekulární podstaty tohoto znaku, umožní studium interakce patogena a hostitele a rovněž vývoj cenných molekulárních markerů pro šlechtění pšenice.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
GE - Plant cultivation
CEP - another secondary branch
EF - Botany
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The authors constructed a genetic and physical map of wheat enabling to map of rezistence to aphids. The results were published in 7 articles in high-impacted scientific journals.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2012
Realization period - end
Dec 31, 2015
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 26, 2015
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP16-GA0-GA-U/01:1
Data delivery date
Sep 25, 2017
Finance
Total approved costs
9,759 thou. CZK
Public financial support
9,759 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK