Creation of resources for wheat genomics and map-based cloning of resistance genes from chromosome 7D
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 10 (SGA02007GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
521/07/1573
Alternative language
Project name in Czech
Příprava materiálů pro genomiku pšenice a poziční klonování genů pro rezistence na chromozómu 7D
Annotation in Czech
Poziční klonování v obrovském allopolyploidním genomu pšenice seté bylo donedávna považováno za nemožné kvůli přítomnosti tří homeologních genomů a značnému množství repetitivních sekvencí. Jedna ze strategií vedoucích k dosažení tohoto cíle je založenana využití genomických materiálů vytvořených pouze z menších částí genomu. Navrhujeme připravit dvě subgenomové knihovny klonované ve vektoru BAC, specifické pro krátké a dlouhé rameno chromozómu 7D pšenice. Tyto knihovny budou neocenitelným zdrojem přitvorbě fyzických map chromozómu 7D a pozičním klonování několika agronomicky významných genů z tohoto chromozómu, mimo jiné genů pro rezistence ke škůdcům Schizaphis graminum a Diuraphis noxia a patogenům Blumeria graminis, Puccinia triticina, P. striiformis, P. graminis f. sp. tritici nebo Mycosphaerella graminicola. Projekt bude zaměřen na poziční klonování genu Dnx pro rezistenci k mšici D. noxia. Součástí bude vytvoření husté genetické mapy pro oblast genu Dnx a sestavení kontigu BAC klonů
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
GE - Plant cultivation
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
GF - Diseases, pests, weeds and plant protection
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2007
Realization period - end
Dec 31, 2009
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 22, 2009
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP10-GA0-GA-U/02:2
Data delivery date
Jan 22, 2015
Finance
Total approved costs
3,949 thou. CZK
Public financial support
3,949 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK