Physical mapping and functional analysis of gene-rich regions of the short arm of rye chromosome 1 (1RS)
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 6 (SGA02004GA-ST)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Fyzické mapování a funkční analýzy oblastí bohatých na geny krátkého ramene chromozómu 1 žita (1RS)
Annotation in Czech
U více než tří set současných odrůd pšenice je krátké rameno chromozómu 1B nahrazeno krátkým ramenem chromozómu 1 žita (1RS). Přítomnost 1RS zvyšuje odolnost vůči řadě chorob a škůdců a zlepšuje adaptabilitu a výnos pšenice. Geny zodpovědné za tyto vlastnosti nebyly dosud izolovány. Na základě nejnovějších výsledků se předpokládá, že se nacházejí ve specifických oblastech bohatých na geny a že tyto oblasti představují jen malou část chromatinu 1RS. Cílem tohoto projektu je oblasti bohaté na geny identifikovat, určit jejich polohu na 1RS a připravit jejich fyzické mapy. Současně bude řada potenciálních genů identifikována sekvenováním cDNA a nízkokopiových sekvencí DNA z 1RS a porovnáním získaných sekvencí se známými sekvencemi DNA. Izolace cDNA z různých pletiv umožní identifikovat potenciální tkáňově specifické geny na 1RS. Vedle získání závažných poznatků budou výsledkem řešení projektu unikátní materiály, které perspektivně umožní efektivní izolaci všech genů a regulačních sekvencí DNA na
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
GE - Plant cultivation
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
EF - Botany
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
A BAC library specific for the short arm of rye chromosome 1R was constructed. This library is the first of its kind in rye and its availability represents a significant step forward in the development of genome resources for this crop. Moreover, a set o
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2004
Realization period - end
Jan 1, 2006
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP07-GA0-GA-U/03:2
Data delivery date
Oct 16, 2007
Finance
Total approved costs
5,035 thou. CZK
Public financial support
3,255 thou. CZK
Other public sources
2,670 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK