Construction of chromosome-specific DNA libraries of barley (Hordeum vulgare L.) and their use in genome mapping
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
—
Main participants
Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
Contest type
—
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Konstrukce chromozómově specifických DNA knihoven ječmene (Hordeum vulgare L.) a jejich využití pro mapování genomu
Annotation in Czech
Projekt je zaměřen na konstrukci chromozómově specifických knihoven pro vybrané typy chromozomů ječmene. Při konstrukci knihoven bude použito translokovaných linií ječmene. Budou vyvinuty metody pro izolaci a třídění chromozomů ječmene pomocí průtokové cytometrie. DNA z tříděných chromozómů bude amplifikována pomocí DOP-PCR (degenerate oligonucleotide-promed PCR) a použita ke konstrukci knihoven krátkých inzertů. Ty budou charakterizovány z hlediska délky klonovaných inzertů, reprezentativnosti a obsahjedinečných a opakujících se sekvencí. Bude syntetizována cDNA a její hybridizací s chromozómově specifickou DNA, získanou po DOP-PCR, budou vyselektovány chromozómově specifické populace cDNA. Předpokládá se využití chromozómově specifických knihoven prizolaci chromozómově specifických markerů a pro lokalizaci genů na chromozómech nebo jejich částech a také možnost využití chromozómově specifické cDNA pro přípravu komplexních sond pro "chromosome painting".
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
GE - Plant cultivation
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
EF - Botany
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Postup a metodika prací jsou v souladu se stanoveným záměrem. Práce je adekvátně publikována ve 2 článcích in extenzo, 1 odeslán do tisku, řada příspěvků na konferencích. Finanční prostředky čerpány v souladu s plánem.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 1998
Realization period - end
Jan 1, 2000
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2001/GA0/GA01GA/U/N/9:4
Data delivery date
—
Finance
Total approved costs
652 thou. CZK
Public financial support
530 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK