Isolation and sorting of cereal chromosomes for genome mapping
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
—
Main participants
Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
Contest type
—
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Nové metody izolace a třídění chromozómů a jejich využití při studiu organizace genomu obilovin
Annotation in Czech
Cílem projektu je podstatně zefektivnit studium genomu obilovin. U čtyř ekonomicky významných druhů (Zea mays, Secale cereale, Hordeum vulgare a Triticum aestivum) navrhujeme vypracovat postupy pro konstrukci chromozómově-specifických knihoven DNA a prozískávání směsných DNA vhodných pro vizualizace jednotlivých typů chromozómů pomocí in situ hybridizace ('chromosome painting'). Konkrétně bude projekt zaměřen na vypracování metod izolace intaktních chromozómů, včetně metod pro jejich analýzu a tříděníomocí průtokové cytometrie. Předpokládáme využití linií s chromozomálními translokacemi, u kterých je možné cytometricky rozlišit specifické typy chromozómů. Nediskriminovatelné typy chromozómů budou selektivně značeny pomocí metody PRINSES (Primed in siu labelling en suspension) a tříděny na základě tohoto značení. Konečným cílem bude rozšíření postupu na všechny typy chromozómů uvedených druhů, včetně B chromozómů. Tříděné frakce vybraných typů chromozómů budou použity pro konstrukci chromozómově-spec
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
9H - 9
CEP - secondary branch
EF - Botany
CEP - another secondary branch
EI - Biotechnology and bionics
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>20801 - Environmental biotechnology<br>20802 - Bioremediation, diagnostic biotechnologies (DNA chips and biosensing devices) in environmental management<br>20803 - Environmental biotechnology related ethics<br>20901 - Industrial biotechnology<br>20902 - Bioprocessing technologies (industrial processes relying on biological agents to drive the process) biocatalysis, fermentation<br>20903 - Bioproducts (products that are manufactured using biological material as feedstock) biomaterials, bioplastics, biofuels, bioderived bulk and fine chemicals, bio-derived novel materials<br>30401 - Health-related biotechnology<br>30402 - Technologies involving the manipulation of cells, tissues, organs or the whole organism (assisted reproduction)<br>30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])<br>30404 - Biomaterials (as related to medical implants, devices, sensors)<br>30405 - Medical biotechnology related ethics<br>40401 - Agricultural biotechnology and food biotechnology<br>40402 - GM technology (crops and livestock), livestock cloning, marker assisted selection, diagnostics (DNA chips and biosensing devices for the early/accurate detection of diseases) biomass feedstock production technologies, biopharming<br>40403 - Agricultural biotechnology related ethics
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 1996
Realization period - end
Jan 1, 1996
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/1997/GA0/GA07GA/V/9:7
Data delivery date
—
Finance
Total approved costs
0 thou. CZK
Public financial support
1,780 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK