Isolation and sorting of cereal chromosomes for genome mapping
Project goals
—
Keywords
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
—
Main participants
Ústav experimentální botaniky AV ČR, v. v. i.
Contest type
—
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Nové metody izolace a třídění chromozómů a jejich využití při studiu organizace genomu obilovin
Annotation in Czech
Cílem projektu je podstatně zefektivnit studium genomu obilovin. U čtyř ekonomicky významných druhů (Zea mays, Secale cereale, Hordeum vulgare a Triticum aestivum) navrhujeme vypracovat postupy pro konstrukci chromozómově-specifických knihoven DNA a prozískávání směsných DNA vhodných pro vizualizace jednotlivých typů chromozómů pomocí in situ hybridizace ('chromosome painting'). Konkrétně bude projekt zaměřen na vypracování metod izolace intaktních chromozómů, včetně metod pro jejich analýzu a tříděníomocí průtokové cytometrie. Předpokládáme využití linií s chromozomálními translokacemi, u kterých je možné cytometricky rozlišit specifické typy chromozómů. Nediskriminovatelné typy chromozómů budou selektivně značeny pomocí metody PRINSES (Primed in siu labelling en suspension) a tříděny na základě tohoto značení. Konečným cílem bude rozšíření postupu na všechny typy chromozómů uvedených druhů, včetně B chromozómů. Tříděné frakce vybraných typů chromozómů budou použity pro konstrukci chromozómově-spec
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
9H - 9
CEP - secondary branch
EF - Botany
CEP - another secondary branch
EI - Biotechnology and bionics
10611 - Plant sciences, botany
10612 - Mycology
20801 - Environmental biotechnology
20802 - Bioremediation, diagnostic biotechnologies (DNA chips and biosensing devices) in environmental management
20803 - Environmental biotechnology related ethics
20901 - Industrial biotechnology
20902 - Bioprocessing technologies (industrial processes relying on biological agents to drive the process) biocatalysis, fermentation
20903 - Bioproducts (products that are manufactured using biological material as feedstock) biomaterials, bioplastics, biofuels, bioderived bulk and fine chemicals, bio-derived novel materials
30401 - Health-related biotechnology
30402 - Technologies involving the manipulation of cells, tissues, organs or the whole organism (assisted reproduction)
30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])
30404 - Biomaterials (as related to medical implants, devices, sensors)
30405 - Medical biotechnology related ethics
40401 - Agricultural biotechnology and food biotechnology
40402 - GM technology (crops and livestock), livestock cloning, marker assisted selection, diagnostics (DNA chips and biosensing devices for the early/accurate detection of diseases) biomass feedstock production technologies, biopharming
40403 - Agricultural biotechnology related ethics
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 1996
Realization period - end
Jan 1, 1996
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/1997/GA0/GA07GA/V/9:7
Data delivery date
—
Finance
Total approved costs
0 thou. CZK
Public financial support
1,780 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Provider
Czech Science Foundation
CEP
9H - 9
Solution period
01. 01. 1996 - 01. 01. 1996