Old wine in new skin: the role of polyploidization and hybridization in an adaptively-radiated plant group using high-throughput sequencing methods
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Junior Grants
Call for proposals
Juniorské granty 2 (SGA0201600002)
Main participants
Botanický ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
16-15134Y
Alternative language
Project name in Czech
Nový pohled na starou problematiku: role celogenomových procesů v adaptivní radiaci rostlin studovaná pomocí moderních sekvenačních technik
Annotation in Czech
Úloha polyploidizace a mezidruhové hybridizace v adaptivní radiaci rostlin je stále nedostatečně objasněna. Předložený projekt si klade za cíl zjistit, nakolik tyto evoluční mechanismy přispěly k radiaci druhově bohatého a morfologicky a karyologicky variabilního rodu šťavel (Oxalis). V průběhu řešení vytvoříme fylogenetický strom celého rodu (na základě velkého počtu low-copy genů a celého plastidového genomu), na který budeme mapovat polyploidizační a hybridizační události. Zároveň budeme studovat vliv ploidního stupně na rychlost diverzifikace a evoluční úlohu reprodukční izolace u vybraného druhu s vysokou cytotypovou variabilitou. Jedná se o první detailní studium evolučně úspěšné skupiny s adaptivní radiací s využitím metod masivního paralelního sekvenování. Získaná data přispějí k objasnění obecných evolučních mechanismů generujících diverzitu.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EF - Botany
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Junior project was mainly focused on the elaboration of methodical phylogenomic approaches, which were applied on the reconstruction of the evolutionary history of the genus Oxalis. Frequent polyploidization, not accompanied by the hybridization was documented in this genus. Four papers (one of them review) were published, the fifth manuscript is in preparation.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2016
Realization period - end
Dec 11, 2020
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 16, 2018
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP21-GA0-GJ-U/02:1
Data delivery date
Jun 30, 2021
Finance
Total approved costs
6,572 thou. CZK
Public financial support
6,572 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK