Terrestrial protein sequence and structure space evolution
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Junior Grants
Call for proposals
Juniorské granty 3 (SGA0201700002)
Main participants
Univerzita Karlova / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
17-10438Y
Alternative language
Project name in Czech
Evoluce sekvenčního a strukturního prostoru terestriálních bílkovin
Annotation in Czech
Poslední univerzální společný předek již disponoval 20 proteninogenními aminokyselinami, geneticky kódovanými, jak je známe dnes. Mnoho nezávislých studií ale došlo k závěru, že dřívější život používal jen část těchto aminokyselin (tzv. ranné aminokyseliny), zatímco příroda měla k dispozici i jiné, prebioticky dostupné aminokyseliny. Cílem tohoto záměru je prozkoumat vliv výběru aminokyselin na repertoár proteinových struktur z hlediska evoluce genetického kódu, a to pomocí dvou různých přístupů: (i) zkoumáním vzniku sekundárních struktur v knihovnách náhodných sekvencí, generovaných z různých skupin aminokyselin; (ii) za použití “zpětné evoluce” současných bílkovin pomocí ranných aminokyselin s důrazem na zachování strukturní a/nebo funkční integrity. Přínosem tohoto projektu je zodpovězení základních otázek v oblasti ranné evoluce bílkovin a pochopení vztahu mezi totožností aminokyselin a strukturou (příp. funkcí) z nich vzniklých bílkovin. Naše poznání by tak obohatilo poznatky proteinového inženýrství a obecné vnímání světa proteinových struktur, jak ho možná ještě neznáme.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
BO - Biophysics
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10610 - Biophysics
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2017
Realization period - end
Dec 31, 2021
Project status
—
Latest support payment
Apr 10, 2019
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP21-GA0-GJ-R/02:1
Data delivery date
Feb 22, 2021
Finance
Total approved costs
8,369 thou. CZK
Public financial support
8,369 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK