Immunogenetics in the Next Generation Sequencing era: Deciphering the pathogenetic mechanisms in lymphoproliferative disorders
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Junior Grants
Call for proposals
Juniorské granty 5 (SGA0201900002)
Main participants
Masarykova univerzita / Středoevropský technologický institut
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
19-23424Y
Alternative language
Project name in Czech
Imunogenika v sekvencování následující generace: Dešifrování patogenetických mechanismů u lymfoproliferativních poruch
Annotation in Czech
Imunogenetická sekvenační analýza je účinným nástrojem v základním výzkumu zaměřeném na identifikaci mechanismů, které zodpovídají za vznik lymfomů. Vznik vysoce výkonných metod navíc poskytuje hlubší vhled do molekulární analýzy antigenních receptorů a přirozeného vývoje lymfomů. Anaplastický velkobuněčný lymfom (Anaplastic Large Cell Lymphoma, ALCL) lze rozdělit do dvou subtypů: ALK (Anaplastic Lymphoma Kinase) pozitivní (ALK+ ALCL) a ALK negativní (ALK- ALCL). Ve zralém stádiu ALK+ ALCL jsou signály T-buněčného receptoru (TR) nahrazeny konstitutivní aktivitou onkogenní tyrosinkinázy NPM-ALK, přičemž maligní transformace je závislá na rovnováze signálů při vývoji ALK+ ALCL buňky. Povaha signálů zprostředkovaných TR však zůstává předmětem výzkumu. V případě ALK- ALCL dosud nebyly provedeny žádné imunogenetické studie a role TR v patogenezi onemocnění tudíž stále není objasněna. Z toho důvodu provedeme vysoce výkonné profilování repertoáru TR a komparativní analýzu sekvencí u pacientů s ALK+ a ALK- ALCL s cílem objasnit mechanismy ontogeneze těchto onemocnění.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
30101 - Human genetics
OECD FORD - secondary branch
—
OECD FORD - another secondary branch
—
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2019
Realization period - end
Dec 31, 2022
Project status
—
Latest support payment
Apr 24, 2020
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP22-GA0-GJ-R
Data delivery date
Feb 21, 2022
Finance
Total approved costs
5,860 thou. CZK
Public financial support
5,860 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK