Multicolor 3D super-resolution structured illumination microscopy
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 15 (SGA0201400003)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
14-15272P
Alternative language
Project name in Czech
Vícebarevná 3D mikroskopie se superrozlišením s využitím strukturovaného osvětlení
Annotation in Czech
Mikroskopie se superrozlišením se rychle stává důležitým nástrojem biomedicínského výzkumu, neboť dovoluje zobrazovat buňečné struktury pod difrakčním limitem běžných fluorescenčních mikroskopů. Přístupy využívající strukturované osvětlení (SIM) jsou zvláště lákavé vzhledem k jejich poměrné jednoduchosti a použitelnosti pro velkou škálu biologických vzorků. Navrhovaný projekt se zaměřuje na implementaci a vývoj této metody. Budeme teoreticky i experimentálně zkoumat vhodnost různých osvětlovacích vzorůna dosažení vyššího rozlišení, nižšího šumu a tenčích optických řezů. Budeme také vylepšovat numerické metody k získávání snímků se superrozlišením z nasnímaných dat. Nově vyvinuté postupy využijeme při studiu aktuálních problémů v oblasti procesů replikace a transkripce v jádře a jadércích hepatocytů. Vyšší rozlišení dostupné díky SIM zpřesní kolokalizační analýzu replikačních a translačních procesů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
BO - Biophysics
CEP - secondary branch
EA - Morphology and cytology
CEP - another secondary branch
ED - Physiology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology<br>10610 - Biophysics<br>30105 - Physiology (including cytology)
Completed project evaluation
Provider evaluation
O - Nesplněno zadání, smlouva však byla dodržena
Project results evaluation
This project has been terminated on the principal investigator request (the panel 205 agreed). Despite this, 2 papers were published (on software development, 2nd on SIM image postprocessing ) and a book chapter. It is not possible to evaluate fulfilmentof the original aims. The outputs belong to the internationally recognized level.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2014
Realization period - end
Dec 31, 2014
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 25, 2014
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP15-GA0-GP-U/02:2
Data delivery date
May 6, 2016
Finance
Total approved costs
433 thou. CZK
Public financial support
433 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK