Electrochemical methods for bioanalysis of nucleic acids and their application in cancer diagnostics
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 15 (SGA0201400003)
Main participants
Masarykův onkologický ústav
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
14-24931P
Alternative language
Project name in Czech
Elektrochemické metody pro bioanalýzu nukleových kyselin a jejich aplikace v diagnostice nádorových onemocnění
Annotation in Czech
Deregulace genové exprese často vede ke vzniku závažných chorob včetně rakoviny. Velké úsilí je proto věnováno k hledání nových metod pro její analýzu. V rakovinných buňkách byly mezi jinými pozorovány změny v expresi mikroRNA či DNA metylaci. V porovnání s běžně používanými technikami je elektrochemie považována za levnější a rychlejší alternativu s jednodušší instrumentací. Navrhujeme proto aplikovat výsledky našeho nedávného výzkumu elektrochemie nukleových kyselin pro vývoj a optimalizaci postupů, které by vedly ke zlepšení včasné diagnostiky rakoviny. Výzkum bude zaměřen na (i) detekci specifických sekvencí mikroRNA jakožto potenciálních biomarkerů za použití elektroaktivního značení a (ii) rozlišení metylované a nemetylované DNA pomocí reakce s hydrogensiřičitanem sodným, který transformuje redukovatelný cytozin na neredukovatelný uracil, ale nemění redukovatelný metylcytozín. Systematickým přístupem bude optimalizován výběr jednotlivých technik, elektrodových povrchů i elektroaktivních značek, a vhodnost metody bude otestována použitím reálných biologických vzorků.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
BO - Biophysics
CEP - secondary branch
CB - Analytical chemistry, separation
CEP - another secondary branch
CG - Electrochemistry
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10405 - Electrochemistry (dry cells, batteries, fuel cells, corrosion metals, electrolysis)<br>10406 - Analytical chemistry<br>10610 - Biophysics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Significant results were achieved in electroanalytical chemistry of nucleic acids. A number of innovative techniques and methods was developed; they have been successfully applied for the analysis of real samples. The results have potential importance for the early diagnosis of cancer. The project fulfilled its stated goals and the publication output is excellent.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2014
Realization period - end
Dec 31, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 22, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-GA0-GP-U/01:1
Data delivery date
Jun 30, 2017
Finance
Total approved costs
1,956 thou. CZK
Public financial support
1,956 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK