The efect of methylation and acetylation on chromatin structure
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 4 (SGA02003GA2PD)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Vliv metylace a acetylace na strukturu chromatinu
Annotation in Czech
Biochemické modifikace DNA a histonů (zejména metylace a acetylace) patří mezi epigenetické regulační mechanismy, které ovlivňují strukturu chromatinu vzhledem k jeho transkripční aktivitě/inaktivitě. Zmíněné modifikace histonů a DNA fungují často paralelně, ovšem vzájemné vztahy mezi jednotlivými mechanismy epigenetické dědičnosti, např. vztah mezi acetylací histonů versus metylace DNA, nejsou dosud objasněny. V našich experimentech bude studován metylační stav DNA, histonů a acetylační stav histonů nametafázních chromosomech lidských krevních buněk. Dále bude studován vliv hypometylačního a hyperacetylačního činidla na míru metylace/acetylace histonů a DNA. Vliv těchto biochemických modifikací bude rovněž hodnocen s ohledem na strukturu chromatinu vyššího řádu krevních buněk. Fluorescenční in situ hybridizace a imunofluorescenční metody v kombinaci s cytometrií s vysokým rozlišením umožní vizualizaci vybraných metafázních chromosomů vzhledem k jejich obsahu CpG ostrůvků. V nepřímém
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
JD - Use of computers, robotics and its application
CEP - another secondary branch
EA - Morphology and cytology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>20204 - Robotics and automatic control<br>20205 - Automation and control systems<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The DNA methylation states of metaphase chromosomes were studied especially on the chromosome 2 in malignantretinoblastome cell line Y79 and in leukemic celIs K-562. We have observed differences between methylation states ofchromosome 2 in the two ty
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2003
Realization period - end
Jan 1, 2006
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP07-GA0-GP-U/03:2
Data delivery date
Oct 16, 2007
Finance
Total approved costs
736 thou. CZK
Public financial support
736 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK