Evaluation of collagen proteins and peptides during physiological and pathophysiological processes
Project goals
Within the framework of this project it is proposed to electromigration, flow-through and advanced detection methods (more specifically capillary electrophoresis, HPLC, mass spectrometry and immunohistochemistry) for the characterization and tissue localization of collagenous proteins and peptides. Further characterization will be directed towards posttranslational modifications arising from the action of oxo groups possessing compounds (glycation), free oxidizing radicals and NO in vascular collagen and influencing of collagen fragmentation by tissue proteinases. During the study both model samples prepared in vitro and natured samples obtained from hypertriglyceridemic, hypoxic and normoxic laboratory rats will be used. Further experimentswith a model mixtures of peptides/proteins will be directed by towards further development of analytical procedures suitable for the separation of these categories of compounds (micellar electrokinetic chromatography, dynamic coating). This project
Keywords
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 4 (SGA02003GA2PD)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Stanovení změn kolagenních proteinů a peptidů v průběhu fyziologických a patofyziologických procesů
Annotation in Czech
V rámci tohoto projektu se navrhuje využít moderních elektromigračních (kapilární elektroforéza), průtokových (HPLC) a detekčních metod (hmotnostní spektrometrie, imunohistochemie) pro charakterizaci a tkáňovou lokalizaci kolagenních bílkovin a peptidů.Dále se budou charakterizovat posttranslační modifikace vznikající účinkem látek obsahujících reaktivní oxo skupinu (glykace), volných oxidačních radikálů a NO v kolagenu cévní stěny. Řešení zahrnuje rovněž fragmentační postupy aplikovatelné na studovanou bílkovinu včetně ovlivnění štěpitelnosti molekuly tkáňovými metaloproteinázami. Pro studium bude využito jak modelových vzorků připravených in vitro, tak analýzy přirozených vzorků získaných z hypertriglyceridických, hypoxických a normoxickýchpotkanů.Další pokusy s modelovou směsí proteinů a peptidů budou zaměřeny na vývoj analytických metodik vhodných pro dělení těchto látek (micelární elektrokinetická chromatografie, dynamická modifikace vnitřní stěny kapiláry, elektrochromatografie).
Scientific branches
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
By exploiting the complementary nature of HPLC and CE separations (off-line connection) of deeply degraded collagenous structures, it was possible to reveal several minor, but significant, differences in a very complex set of peptides. These differences
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2003
Realization period - end
Jan 1, 2006
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP07-GA0-GP-U/03:2
Data delivery date
Oct 16, 2007
Finance
Total approved costs
732 thou. CZK
Public financial support
732 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
732 CZK thou.
Public support
732 CZK thou.
100%
Provider
Czech Science Foundation
CEP
CE - Biochemistry
Solution period
01. 01. 2003 - 01. 01. 2006