The study of molecular mechanisms of bacterial adaptation to environmental changes using proteomic techniques
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 7 (SGA02007GA1PD)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
203/07/P471
Alternative language
Project name in Czech
Studium molekulárních mechanismů adaptace bakterií na změny prostředí pomocí proteomických technik
Annotation in Czech
Podstatou projektu je zejména posouzení vlivu tří známých regulačních proteinů na proteom bakterie Paracoccus denitrificans v procesech adaptace na změny vnějšího prostředí. Je známo, že tyto proteiny působí jako senzory pro kyslík a dusíkaté terminálníakceptory elektronů. Po vytvoření databáze k identifikaci proteinů na základě nedávno zpřístupněné genomové sekvence bakterie bude provedena podrobná proteomová studie, srovnávající vliv mutací genů pro regulační proteiny na expresi ostatních proteinů vcelobuněčných lyzátech. Proteiny budou separovány dvourozměrnou gelovou elektroforézou a identifikovány hmotnostní spektrometrií. Proteiny se změnami v expresi budou dále podrobeny bioinformatické analýze, u vybraných proteinů budou doplněny funkční analýzy (stanovení enzymových aktivit a hladin mRNA). Ke komplementárnímu srovnání proteinového složení membránových frakcí bude vybrána a testována nová metoda na bázi kapalinové chromatografie a hmotnostní spektrometrie. Vytvořená databáze přeloženého
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2007
Realization period - end
Dec 31, 2009
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 22, 2009
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP10-GA0-GP-U/03:3
Data delivery date
Mar 1, 2016
Finance
Total approved costs
1,431 thou. CZK
Public financial support
1,431 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK