Structure and function of the Trypanosoma brucei guide RNA binding protein 21 and its complex with the guide RNA molecule
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Standardní projekty 7 (SGA02004GA1PD)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Studium vztahu mezi strukturou proteinu gBP21 a gRNA a jejich funkcí při editování RNA u Trypanosoma brucei
Annotation in Czech
Trypanosoma brucei je parazitický prvok způsobující africkou spavou nemoc, která každoročně postihuje několik milionů lidí a jejich dobytek. V současné době není znám žádný účinný způsob léčby. T. brucei je primitivní eukaryot s celou řadou unikátních vlastností, mezi které mimo jiné patří atypické editování mitochondriální mRNA spojené s vystřiháváním a začleňováním uridinů do pre-mRNA. Tento komplexní, mnohastupňový proces je nepostradatelný pro udržení životních funkcí T. brucei. Jelikož se v hostitelských buňkách podobný proces nevyskytuje, představuje editování mitochondriální mRNA ideální cíl pro řízenou léčbu spavé nemoci. V rámci navrženého projektu budeme studovat jeden z počátečních a klíčových procesů editovaní mRNA, kterým je mechanismus rozpoznávání a vazby guide RNA (gRNA) s gRNA vážícím proteinem gBP21. gBP21 katalyzuje vazbu mezi pre-mRNA a gRNA, která slouží jako vzor pro vystřihávání a včleňování uridinů do jinak translačním aparátem nepřeložitelné pre-mRNA. S pomocí
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The project aims at structural characterization of the MRP1/MRP2 complex from T. brucei and assessment of its role in RNA editting. Under native conditions we isolated MRP1 from T. brucei. Subsequent analysis revealed that MRP1 under in vivo conditions f
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2004
Realization period - end
Jan 1, 2006
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP07-GA0-GP-U/03:2
Data delivery date
Oct 16, 2007
Finance
Total approved costs
984 thou. CZK
Public financial support
984 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK