Triplex-forming DNA and its interactions with p53 proteins
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 6 (SGA02006GA1PD)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
204/06/P369
Alternative language
Project name in Czech
DNA vytvářející triplexy a jejich interakce s proteiny p53
Annotation in Czech
Strukturně selektivní interakce s DNA je důležitou charakteristikou nejenom nádorového supresorového proteinu p53 (wtp53), ale i jeho onkogenních mutantních forem (mutp53). Předpokládá se, že při interakci p53 s DNA v buňce je kromě sekvence nukleotidůdůležitá také konformace rozpoznávaného elementu DNA. Tento projekt je zaměřen na studii interakcí jak wtp53, tak vybraných mutp53 s DNA obsahující sekvence, které vytvářejí intramolekulární triplexové struktury v nadšroubovicové DNA (scDNA). Interakce proteinů p53 s DNA obsahující triplexové struktury budou srovnány s již dříve popsanou vazbou p53 na DNA vytvářející jiné lokální struktury (např. křížovou formu). Při řešení této problematiky bude využito několik biochemických a molekulárně biologickýchpřístupů. Důraz bude kladen zejména na metody studia interakce DNA-protein a detekce triplexových struktur DNA in vitro a in vivo. Součástí projektu je vývoj a optimalizace nové techniky pro studium vazby p53 na scDNA založené na imobilizaci
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Using electrophoresis, immunoblotting and precipitation techniques we detected interaction between DNA triplexes and p53, wild type as well as mutant p53 forms. We studied intramolecular DNA triplexes (type T.A.T) in plasmid (pBSK-T69) and its variant wi
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2006
Realization period - end
Dec 31, 2008
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 25, 2008
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP09-GA0-GP-U/03:3
Data delivery date
Jan 22, 2015
Finance
Total approved costs
1,197 thou. CZK
Public financial support
1,197 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK