A study of repetitive sequences in pea (Pisum sativum L.)
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 2 (SGA02002GA-PD)
Main participants
Ústav molekulární biologie rostlin AV ČR
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Studium repetitivních sekvencí u hrachu setého (Pisum sativum L.)
Annotation in Czech
Cílem projektu je izolace nových repetitivních elementů z genomu hrachu (Pisum sativum L.) a jejich detailní charakteristika. Tyto elementy budou vyhledávány na základě hybridizace fágové knihovny se sondami připravenými z repetitivních sekvencízískanýchběhem předběžných experimentů v laboratoři garanta. Tyto sekvence byly izolovány jako nejčetnější v genomu hrachu (vyskytují se v řádu 1000 -10000 kopií na haploidní genom) a představují pravděpodobně části zcela nových repetitivních elementů.Molekulární a cytogenetická analýza kompletních sekvencí těchto elementů přinese cenné informace o složení a organizaci genomu hrachu. Kromě toho, sledování jejich výskytu u dalších druhů z čeledi Fabaceae rozšíří naše znalosti o příbuznosti těchtodruhů. Získané repetitivní sekvence bude také možné využít pro genetické mapování.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
GE - Plant cultivation
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The project was aimed at isolation and characterization of new full-length repetitive elements related to selected partial repetitive sequences previously identified in the pea genome. We have characterized two novel families of LTR retrotransposons. One
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2002
Realization period - end
Jan 1, 2004
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2005/GA0/GA05GP/U/N/A:8
Data delivery date
Jul 23, 2008
Finance
Total approved costs
1,026 thou. CZK
Public financial support
672 thou. CZK
Other public sources
354 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK