Origin, structure, and destiny of transcripts derived from repetitive sequences in plants
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
The research grant projects for juniors
Call for proposals
Juniorské badatelské grantové projekty 6 (SAV02008-B)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
KJB500960802
Alternative language
Project name in Czech
Původ, struktura a osud transkriptů repetitivních sekvencí u rostlin
Annotation in Czech
Repetitivní sekvence tvoří velkou část genomů většiny eukaryot. Ačkoli byly dlouhou dobu považovány pouze za genomické parazity či nepotřebnou DNA, nedávné výsledky ukázaly, že některé repetitivní sekvence hrají významnou roli v řadě biologických procesů, z nichž některé jsou závislé na jejich transkripci. Hlavním cílem tohoto projektu je detailní analýza transkripční aktivity různých rodin repetitivních sekvencí u širšího spektra rostlinných druhů. Příslušná data budou získána použitím bioinformatických přístupů kombinovaných s molekulárními a cytogenetickými technikami. Transkripty repetitivních sekvencí budou analyzovány s důrazem nejen na jejich původ a strukturu, ale také na jejich posttranskripční úpravy a konečný osud. Výsledky získané během tohoto projektu budou důležité k rozluštění potenciální biologické funkce repetitivních sekvencí a k lepšímu porozumění jejich interakce s hostitelskými genomy.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EA - Morphology and cytology
CEP - another secondary branch
ED - Physiology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30105 - Physiology (including cytology)
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
In the course of this project it has been demonstrated that 1) all tested types of repetitive sequences are transcribed, although abundances of their transcripts differ and 2) that the transcripts are processed by RNAi into siRNA.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2008
Realization period - end
Dec 31, 2010
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 9, 2010
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP11-AV0-KJ-U/02:2
Data delivery date
Jun 14, 2011
Finance
Total approved costs
1,963 thou. CZK
Public financial support
1,963 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK