All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Origin, structure, and destiny of transcripts derived from repetitive sequences in plants

Public support

  • Provider

    Academy of Sciences of the Czech Republic

  • Programme

    The research grant projects for juniors

  • Call for proposals

    Juniorské badatelské grantové projekty 6 (SAV02008-B)

  • Main participants

  • Contest type

    VS - Public tender

  • Contract ID

    KJB500960802

Alternative language

  • Project name in Czech

    Původ, struktura a osud transkriptů repetitivních sekvencí u rostlin

  • Annotation in Czech

    Repetitivní sekvence tvoří velkou část genomů většiny eukaryot. Ačkoli byly dlouhou dobu považovány pouze za genomické parazity či nepotřebnou DNA, nedávné výsledky ukázaly, že některé repetitivní sekvence hrají významnou roli v řadě biologických procesů, z nichž některé jsou závislé na jejich transkripci. Hlavním cílem tohoto projektu je detailní analýza transkripční aktivity různých rodin repetitivních sekvencí u širšího spektra rostlinných druhů. Příslušná data budou získána použitím bioinformatických přístupů kombinovaných s molekulárními a cytogenetickými technikami. Transkripty repetitivních sekvencí budou analyzovány s důrazem nejen na jejich původ a strukturu, ale také na jejich posttranskripční úpravy a konečný osud. Výsledky získané během tohoto projektu budou důležité k rozluštění potenciální biologické funkce repetitivních sekvencí a k lepšímu porozumění jejich interakce s hostitelskými genomy.

Scientific branches

  • R&D category

    ZV - Basic research

  • CEP classification - main branch

    EB - Genetics and molecular biology

  • CEP - secondary branch

    EA - Morphology and cytology

  • CEP - another secondary branch

    ED - Physiology

  • OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

    10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>30105 - Physiology (including cytology)

Completed project evaluation

  • Provider evaluation

    U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)

  • Project results evaluation

    In the course of this project it has been demonstrated that 1) all tested types of repetitive sequences are transcribed, although abundances of their transcripts differ and 2) that the transcripts are processed by RNAi into siRNA.

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    Jan 1, 2008

  • Realization period - end

    Dec 31, 2010

  • Project status

    U - Finished project

  • Latest support payment

    Mar 9, 2010

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Data delivery code

    CEP11-AV0-KJ-U/02:2

  • Data delivery date

    Jun 14, 2011

Finance

  • Total approved costs

    1,963 thou. CZK

  • Public financial support

    1,963 thou. CZK

  • Other public sources

    0 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    0 thou. CZK