Isolation of hypervariable microsatellites suitable for identification of flax germplasm.
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Standard projects
Call for proposals
Standardní projekty 2 (SGA02003GA-ST)
Main participants
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Izolace hypervariabilních mikrosatelitů vhodných pro identifikaci kultivarů a genotypů lnu.
Annotation in Czech
Navrhovaný grantový projekt je předkládán pro nezbytnost zajištění pokračování experimentů započatých v rámci řešení projektu GA ČR "Vývoj mikrosatelitních (MS) markerů pro len", projekt č. 521/00/0075. Původní projekt končí v r. 2002. V rámci původníhoprojektu byla získána řada významných výsledků (experimentální data pro 6 impaktových publikací). Důvodem pro podání návrhu pokračovacího projektu je potřeba dokončit náročný vývoj mikrosatelitních markerů. Přínos nového projektu spočívá v a) vývojinovýchtechnologií a b) v produkci nových teoretických poznatků o struktuře genomu lnu a může být shrnut do následujících bodů: a) Produkce MS-obohacených genomových knihoven lnu, b) Produkce genomových sekvencí z bezprostředního okolí MS lokusů (získanésekvence obohatí mezinárodní databázi sekvencí GenBank o nové sekvence lnu, tyto sekvence budou dále podrobeny bioinformatické analýze užitím softwaru DNASIS pro získání nových poznatků o struktuře genomu lnu v oblasti repetitivních sekvencí, c) Produkce
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
GE - Plant cultivation
CEP - secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - another secondary branch
EI - Biotechnology and bionics
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>20801 - Environmental biotechnology<br>20802 - Bioremediation, diagnostic biotechnologies (DNA chips and biosensing devices) in environmental management<br>20803 - Environmental biotechnology related ethics<br>20901 - Industrial biotechnology<br>20902 - Bioprocessing technologies (industrial processes relying on biological agents to drive the process) biocatalysis, fermentation<br>20903 - Bioproducts (products that are manufactured using biological material as feedstock) biomaterials, bioplastics, biofuels, bioderived bulk and fine chemicals, bio-derived novel materials<br>30101 - Human genetics<br>30401 - Health-related biotechnology<br>30402 - Technologies involving the manipulation of cells, tissues, organs or the whole organism (assisted reproduction)<br>30403 - Technologies involving identifying the functioning of DNA, proteins and enzymes and how they influence the onset of disease and maintenance of well-being (gene-based diagnostics and therapeutic interventions [pharmacogenomics, gene-based therapeutics])<br>30404 - Biomaterials (as related to medical implants, devices, sensors)<br>30405 - Medical biotechnology related ethics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)<br>40401 - Agricultural biotechnology and food biotechnology<br>40402 - GM technology (crops and livestock), livestock cloning, marker assisted selection, diagnostics (DNA chips and biosensing devices for the early/accurate detection of diseases) biomass feedstock production technologies, biopharming<br>40403 - Agricultural biotechnology related ethics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The significance of the project consists in the development of new DNA markers for cultivated flax and, more generaly, for the genus Linum L. Namely, a) sequence characterized amplified (SCAR) markers from microsatellite flanking regions of flax genome w
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2003
Realization period - end
Jan 1, 2005
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP06-GA0-GA-U/07:6
Data delivery date
Jan 15, 2009
Finance
Total approved costs
4,725 thou. CZK
Public financial support
2,785 thou. CZK
Other public sources
1,940 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK