All

What are you looking for?

All
Projects
Results
Organizations

Quick search

  • Projects supported by TA ČR
  • Excellent projects
  • Projects with the highest public support
  • Current projects

Smart search

  • That is how I find a specific +word
  • That is how I leave the -word out of the results
  • “That is how I can find the whole phrase”

Development of flax microsatelite markers

Public support

  • Provider

    Czech Science Foundation

  • Programme

    Standard projects

  • Call for proposals

    Standardní projekty 1 (SGA02002GA-ST)

  • Main participants

    Ústav molekulární biologie rostlin AV ČR

  • Contest type

    VS - Public tender

  • Contract ID

Alternative language

  • Project name in Czech

    Vývoj mikrosatelitních markerů pro len

  • Annotation in Czech

    Podstatou řešení projektu je vývoj mikrosatelitních (SSR) markerů pro identifikaci a rozlišení kultivarů a genotypů lnu. Kultivar specifické mikrosatelitní markery budou generovány a) pomocí "microsatellite-directed PCR" (MS-PCR), b) skrinováním SSR-obohacených knihoven. Projektová aktivita b) bude realizována v rámci mezinárodního lnového konzorcia koordinovaného z Kanady. V rámci této spolupráce náš tým bude garantovat osekvenování nejméně 100 klonů ročně z mikrosatelitních knihoven. Navrhována testování primerů pro SSR lokusy bude pak směřovat k vyvinuti rutinního PCR testu pro identifikaci kultivarů lnu. SSR markery z MS-PCR budou klonovány a testován jejich polymorfismus s cílem konstrukce kultivarových diskriminátorů pro rutinní fingerprinting lnu. Data z fingerprintingových testů kultivarů budou zpracovávána v softwarovém prostředí "GelCompar", což je mezinárodně uznávaný standard (požadovaný jako investice). SSR sekvence, "flanking primer" sekvence a data fingerprintingu

Scientific branches

  • R&D category

  • CEP classification - main branch

    GE - Plant cultivation

  • CEP - secondary branch

    EB - Genetics and molecular biology

  • CEP - another secondary branch

    EA - Morphology and cytology

  • OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)

    10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)

Completed project evaluation

  • Provider evaluation

    V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)

  • Project results evaluation

    Cílem projektu byl vývoj mikrosatelitních markerů lnu. Byla optimalizována metoda ISSR-PCR pro fingerprinting lnu. Během projektu byla provedena clusterová analýza 53 odrůd lnu a byla vytvořena obohacená genomová knihovna. Řešitel výsledky a průběh řešen

Solution timeline

  • Realization period - beginning

    Jan 1, 2000

  • Realization period - end

    Jan 1, 2002

  • Project status

    U - Finished project

  • Latest support payment

Data delivery to CEP

  • Confidentiality

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

  • Data delivery code

    CEP/2003/GA0/GA03GA/U/N/9:7

  • Data delivery date

    May 19, 2008

Finance

  • Total approved costs

    2,063 thou. CZK

  • Public financial support

    1,585 thou. CZK

  • Other public sources

    0 thou. CZK

  • Non public and foreign sources

    0 thou. CZK