The role of repetitive DNA in plant genome architecture and function
Public support
Provider
Ministry of Education, Youth and Sports
Programme
KONTAKT II
Call for proposals
KONTAKT II 1 (SMSM2011LH1)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
MSMT-6784/2013-311
Alternative language
Project name in Czech
Repetitivní DNA a její význam pro strukturu a funkci rostlinného genomu
Annotation in Czech
Cílem projektu je aplikace nejmodernějších sekvenačních, bioinformatických a molekulárně-cytogenetických metod na výzkum repetitivní DNA v genomech vyšších rostlin. Projekt je zaměřen především na zjištění složení repetitivních sekvencí v druzích lišících se velikostí a dalšími vlastnostmi svých genomů, na objasnění strukturní a funkční úlohy repetitivní DNA v centromerách a dalších specifických oblastech chromozómů a dále na výzkum molekulárních mechanizmů způsobujících hromadění nebo eliminaci repeticv genomech rostlin.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
GE - Plant cultivation
CEP - another secondary branch
EF - Botany
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics<br>40105 - Horticulture, viticulture<br>40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Comparative analysis of global repeat composition was performed for groups of species possesing small (Musaceae) and medium-sized genomes (Fabeae). In addition, investigation of structure and sequence composition of centromeric regions of Solanaceae andFabeae chromosomes was performed. The results are important for our understanding of repeat evolution and centromere determination in plants.
Solution timeline
Realization period - beginning
Mar 1, 2011
Realization period - end
Dec 31, 2014
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Mar 3, 2014
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP15-MSM-LH-U/01:1
Data delivery date
Jul 2, 2015
Finance
Total approved costs
6,277 thou. CZK
Public financial support
3,890 thou. CZK
Other public sources
2,387 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK