Characterisation of functional diversity of the plant-specific SMH family of proteins
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 8 (SGA02008GA1PD)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
521/08/P452
Alternative language
Project name in Czech
Charakterizace a funkční diverzita proteinů rodiny SMH, která je specifická pro rostliny
Annotation in Czech
Proteiny AtTRB patří do skupiny SMH proteinů, které jsou definovány přítomností Myb domény na svém N-konci, centrální H1/5 doménou a C-koncovou coiled-coil doménou. Proteiny typu SMH jsou specifické pouze pro rostlinnou říši a jejich členové se váží Mybdoménou typu telobox nejen na rostlinné telomerické repetice, ale také mohou mít regulační funkci v promotorech jiných genů. Do současné doby byly v naší laboratoři charakterizovány tři proteiny z této skupiny. Ačkoliv byla u všech proteinů prokázána specifická vazba na ds-telomerické repetice a u některých také na G-bohaté vlákno telomerické repetice, v dvojhybridním systému se jednotlivé proteiny významně liší svými interakčními partnery. Cílem tohoto projektu je vyhledat interakční partnery přímo v rostlinném systému pomocí metody TAP-tag, která umožňuje šetrnou dvojkrokovou purifikaci proteinů. Projekt by měl také s použitím ChIP analýzy pomoci vyřešit otázku, zda jsou AtTRB proteiny lokalizovány na telomerách a nebo rozeznávají intersticiální
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The work on the project ?Characterisation of functional diversity of the plant-specific SMH family of proteins? has brought original results regarding the analysis of the role of the plant AtTRB proteins in vitro or in vivo. The solution of the project has resulted in the following outputs: clarification of the AtTRB binding specificity; design of a binding model of the separate AtTRB domains to
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2008
Realization period - end
Dec 31, 2010
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 16, 2010
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP11-GA0-GP-U/04:3
Data delivery date
Mar 20, 2015
Finance
Total approved costs
1,344 thou. CZK
Public financial support
1,344 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK