Characterization of protein binding factors for porcine reproductive and respiratory syndrome virus and differentiation of Czech strains by RFLP
Project goals
Porcine reproductive and respiratory syndrome virus has been reported to have a restricted tropism for cells of the monocyte lineage. MARC-145 and CL 2621 cells both derived from the MA-104 monkey kidney cell line are the only non-porcine cells known tosupport PRRSV replication in vitro. No viral receptor which determine tropism of the virus have been identified so far. This project will contribute to characterization of interaction between virus and cell surface. Differentiation of Czech isolates clustered in the phylogenetic tree into two clades will be performed using RFLP analysis of ORF5 part of the genome. This gene encoding major envelope glycoprotein GP5 is probably involved in attachment of the virus to the cells and/or fusion of viral envelope with endosome membrane.
Keywords
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 2 (SGA02002GA-PD)
Main participants
Výzkumný ústav veterinárního lékařství, v.v.i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Charakterizace faktorů ovlivňujících vazbu viru reprodukčního a respiračního syndromu prasat na buňku a diferenciace českých kmenů metodou RFLP
Annotation in Czech
Virus reprodukčního a respiračního syndromu prasat má stejně jako ostatní zástupci čeledi Arteriviridae vyhraněný tropismus k buňkám monocytové řady. In vitro je možno virus množit v buňkách alveolárních makrofágů a buněčných liniích MARC-145 a CL 2621 derivovaných z linie MA-104 (buňky opičích ledvin). Tropismus viru je určen přítomností specifického receptoru na povrchu těchto buněk, který však nebyl doposud identifikován. Předkládaný návrh přispěje k charakterizaci faktorů ovlivňujících prvotní interakce viru s buňkou. Rovněž bude v rámci tohoto projektu zavedena metoda na diferenciaci českých izolátů PRRSV na základě RFLP analýzy ORF5 části genomu. Tento gen kóduje protein, který se pravděpodobně účastní vazby viru na buňku a/nebo fuze obalu virionu s membránou endozómu.
Scientific branches
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Výsledky jsou adekvátní době řešení. Přiložen rukopis článku, který je připraven k publikaci. Nedoložen podrobný rozpis čerpání finančních prostředků. Projekt je ukončen po 1. roce řešení z důvodu ohlášené dlouhodobé nepřítomnosti řešitele v ČR.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2001
Realization period - end
Jan 1, 2003
Project status
S - Stopped (prematurely terminated) multi-year project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2002/GA0/GA02GP/U/N/6:2
Data delivery date
Nov 19, 2002
Finance
Total approved costs
205 thou. CZK
Public financial support
205 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
205 CZK thou.
Public support
205 CZK thou.
100%
Provider
Czech Science Foundation
CEP
GJ - Diseases and animal vermin, veterinary medicine
Solution period
01. 01. 2001 - 01. 01. 2003