Epigenetic gene silencing in colorectal cancer- a potential biomarker for early diagnosis and efficacy of chemotherapy
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 11 (SGA02011GA1PD)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P304-11-P715
Alternative language
Project name in Czech
Epigenetické umlčení genů v kolorektálním karcinomu-potenciální biomarker časné diagnózy a účinnosti chemoterapie
Annotation in Czech
Nové poznatky naznačují, že rakovina je onemocněním určovaným jak genetickými faktory a chromozomálními abnormalitami, tak faktory epigenetickými. Změny DNA metylací pak výrazně ovlivňují genové exprese. Ztráta funkce kritických genů epigenetickým potlačením může hrát klíčovou roli v rozvoji a progresi sporadických tumorů, včetně kolorektálního karcinomu (CRC). Ježto je nezanedbatelné procento CRC podmíněno defekty v DNA mismatch reparaci (MMR), zamýšlíme zkoumat epigenetické alterace v MMR genech v souvislosti s jejich přítomností jak v cílových nádorových tkáních, tak i tkáních necílových, jako jsou periférní krevní leukocyty. Vycházíme z hypotézy, že zmíněné alterace mohou sloužit jako charakterizující ukazatel rizika celkového procesu karcinogeneze. Hlavním cílem projektu je poskytnutí prvotních údajů o roli změn v promotorové metylaci v souvislosti s účinností chemoterapie (fenotyp metylací CpG ostrůvků má souvislost s lepším přežívaním po léčbě 5-fluorouracilem) a celkovým vlivem na prognózu CRC.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
In patients with colorectal carcinomas, gene expression and promoter methylation was assayed in selected genes, which could serve as biomarkers, A new diagnostic Mlh1 mutation was described. All aims have been adequately solved.. The results of this study were already published in two communications.. The project brings interesting results as well as new impetus for the next research.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2011
Realization period - end
Dec 31, 2013
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jun 6, 2013
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP15-GA0-GP-U/02:2
Data delivery date
May 6, 2016
Finance
Total approved costs
3,012 thou. CZK
Public financial support
3,012 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK