Depicting a functional model of NTP303 mRNA translational repression during tobacco pollen maturation
Project goals
Posttranscriptional control of gene expression plays a vital role during tobacco pollen maturation and pollen tube growth. A pollen-specific gene NTP303 encoding N-glycosylated p69 kDa protein is an essential component of the pollen tube cell wall. The expression of NTP303 gene is detected early at pollen stage 3, however, the encoded mRNAs are translationally repressed and stored within characteristic ribonucleoprotein particles. At the initiation of pollen tube growth, stored NTP303 transcripts are massively translated and the encoded glycoprotein is deposited into the extending pollen tube wall. The aim of our project is to elucidate the mechanism(s) imposed to repress the translation of NTP303 mRNA during pollen maturation. Our objective is to usethis unique model system to (i) isolate regulatory RNA binding protein(s) with a potential repressing activity that could participate in sequestering NTP303 mRNA translation and to demonstrate their function. Simultaneously, (ii) we also intend to investigate using in-depth sequencing approach a possible contribution of microRNAs as an alternative or additional mechanism imposed posttranscriptionally to modulate NTP303 expression during pollen maturation and pollen tube growth.
Keywords
pollenmalegametophyteproteomicstranslationregulationmRNPRNA-bindingproteinsmicroRNAs
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 11 (SGA02011GA1PD)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P501-11-P321
Alternative language
Project name in Czech
Mechanismus represe translace modelového transkriptu NTP303 během zrání pylu tabáku
Annotation in Czech
Posttranskripční kontrola genové exprese hraje zásadní roli při zrání pylu a následném růstu pylové láčky. Pylově specifický gen NTP303 kódující N-glykosylovanou bílkovinu o Mw 69 kDa je integrální složkou buněčné stěny pylové láčky stěny. Silná expresegenu NTP303 začíná již v časných stádiích vývoje pylového zrna, nicméně translace příslušných NTP303 mRNA je kompletně zablokována a tyto transkripty zůstávají uloženy v charakteristických ribonukleoproteinových částicích. Bezprostředně po vyklíčení pyluje iniciována masivní translace NTP303 transkriptů a kódovaný glykoprotein je ukládán ve stěně roztoucí pylové láčky. Cílem našeho projektu je objasnění mechanismu(ů) represe translace NTP303 mRNA během zrání pylu. Naším cílem je využít tento unikátní modelový systém k (i) izolaci bílkovin vázaných na NTP303 mRNAs pravděpodobnou regulační aktivitou, která blokuje její translaci a (ii) prokázat tuto regulační (represivní) funkci. Současně hodláme ověřit možný alternativní/souběžný mechanismus posttranslační inaktivace exprese NTP303 mRNA prostřednictvím mikroRNA, jak již bylo demonstrováno pro jiné geny.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
ED - Physiology
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
30105 - Physiology (including cytology)
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The junior project yielded valuable data dealing with regulation of translation in pollen cells. These results were published in two important international scientific journals and the principal investigator was always the first author.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2011
Realization period - end
Dec 31, 2013
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jun 7, 2013
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP15-GA0-GP-U/02:2
Data delivery date
May 6, 2016
Finance
Total approved costs
3,034 thou. CZK
Public financial support
3,034 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
3 034 CZK thou.
Public support
3 034 CZK thou.
100%
Provider
Czech Science Foundation
CEP
ED - Physiology
Solution period
01. 01. 2011 - 31. 12. 2013