The role of mitogen-activated protein kinases (MPKs) in barley responses to Puccinia hordei attack
Project goals
In the proposed research we plan to reveal the role of mitogen-activated protein kinases (MPKs) in barley responses to Puccinia hordei. In our preliminary bioinformatic search we have identified putative barley orthologues of three MPKs that were previously shown to be involved in host responses to pathogens, mostly in dicotyledonous plants. We plan to investigate their activation upon inoculation of two barley cultivars and one line that differentially interact with P.hordei (vertical or partial resistance or susceptibility). Further, transgenic lines will be generated from the same barley genetic pool carrying either silenced putative MPKs or overexpressing their constitutively active forms. We will prepare 18 transgenic lines in total to cover all possible combinations MPK/construct/genotype. The lines will be inoculated at seedling stage and phenotyped for the disease development and pathogen responses by cell biological, molecular biological and biochemical approaches. Selected lines will be also further evaluated for pathogen responses by cDNA microarray and by proteomics.
Keywords
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 12 (SGA02012GA1PD)
Main participants
Univerzita Palackého v Olomouci / Přírodovědecká fakulta
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P501-12-P455
Alternative language
Project name in Czech
Úloha mitogen-aktivovaných protein kináz (MPKs) v odpovědích ječmene na napadení Puccinia hordei
Annotation in Czech
V předkládaném projektu plánujeme objasnit roli mitogen-aktivovaných protein kináz (MPKs) v odpovědích ječmene na napadení Puccinia hordei. Pomocí bioinformatické analýzy jsme předběžně identifikovali domělé ortology tří MPKs, o nichž je zatím převážně u dvouděložných rostlin známo, že se účastní odpovědí hostitele na patogena. Budeme sledovat aktivaci těchto ortologů po inokulaci dvou odrůd a jedné linie ječmene, které se liší povahou interakce s P. hordei (vertikální nebo parciální rezistence nebo náchylnost). Dále z těchto odrůd/linie připravíme transgenní linie, ve kterých budou identifikované MPKs umlčeny nebo nadprodukovány v konstitutivně aktivní forme. Celkem získáme 18 transgenních linií ječmene tak, abychom pokryli všechny kombinace MPK/konstrukt/genotyp. Transgenní linie budou inokulovány ve fázi klíčních rostlin a následný průběh napadení a odpovědi na patogena budou fenotypovány pomocí buněčně biologických, molekulárně genetických a biochemických přístupů. Odpovědi vybraných linií na patogena budou navíc dále studovány pomocí cDNA microarray a proteomiky.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)
10605 - Developmental biology
10608 - Biochemistry and molecular biology
10609 - Biochemical research methods
30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Great achievements in the bioinformatics identification and characterization of interaction of barley with Puccinia hordei and related areas were reached.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2012
Realization period - end
Apr 7, 2016
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Apr 1, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP17-GA0-GP-U/01:1
Data delivery date
Jun 30, 2017
Finance
Total approved costs
2,215 thou. CZK
Public financial support
2,215 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK
Basic information
Recognised costs
2 215 CZK thou.
Public support
2 215 CZK thou.
100%
Provider
Czech Science Foundation
CEP
EB - Genetics and molecular biology
Solution period
01. 01. 2012 - 07. 04. 2016