Electron transfer reactions in the bacterial flavoenzyme FerB: molecular mechanisms, evolutionary aspects and enzyme engineering
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 10 (SGA02010GA1PD)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
P503-10-P217
Alternative language
Project name in Czech
Přenos elektronů v bakteriálním flavoenzymu FerB: molekulární mechanismy, evoluční aspekty a enzymové inženýrství
Annotation in Czech
Enzym FerB byl naší skupinou zařazen do rodiny NADPH-dependentních FMN reduktas, redukující kromě Fe(III)komplexů i chromany a především chinony. FerB redukuje benzochinony dvouelektronově, naftochinony a chromát mechanismem jednoelektronovým za produkcereaktivních forem kyslíku. Rekombinantní enzym má stejné enzymové aktivity jako vlastní protein FerB a navíc snadno krystalizuje, což jsou dvě nezbytné podmínky pro další strukturně-funkční studie, které navrhujeme v předkládaném projektu s proteinem provést. Vyřešení 3D struktury celého proteinu umožní určit uspořádání aminokyselin v aktivním místě a následná evoluční studie by měla vést k pochopení důvodu dvojakosti samotného reakčního mechanismu a způsobu, kterým jsou radikály generovány. Aminokyseliny, které hrají při redukci substrátu největší roli, budou mutovány. Nejlépe pozměněný protein bude charakterizován s ohledem na jeho nové strukturní a funkční vlastnosti. Bude testováno možné využití biosenzoru s imobilizovaným rFerB.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
DK - Contamination and decontamination of soil including pesticides
CEP - secondary branch
CE - Biochemistry
CEP - another secondary branch
EB - Genetics and molecular biology
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10511 - Environmental sciences (social aspects to be 5.7)<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
The project acheived valuabel results, published in two articles in WoS impacted journals. One of them (in PLoS ONE) falls into the Q1 and is of a very good quality. Taking into consideration the fact, that this is a postdoctoral project, the result might be considered excellent.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2010
Realization period - end
Dec 8, 2014
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Jan 1, 2016
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP15-GA0-GP-U/02:2
Data delivery date
May 6, 2016
Finance
Total approved costs
985 thou. CZK
Public financial support
985 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK