What do the most abundant oceanic protistan proteins actually do?
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Grant projects of excellence in basic research EXPRO
Call for proposals
SGA0202300004
Main participants
Biologické centrum AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
23-06479X
Alternative language
Project name in Czech
Co vlastně dělají nejběžnější bílkoviny v oceánu?
Annotation in Czech
Prvoci jsou nejpočetnějšími a nejdiverznějšími eukaryoty oceánů,což je největší ekosystém na Zemi. Kvůli extrémní rozmanitosti,obtížím s kultivací a jen omezeným genetickým manipulacím víme překvapivě málo o bílkovinách mořských prvoků,což platí i o těch nejčastějších. Za použití pokročilých bioinformatických metod jsme z milionů analyzovaných sekvencí určili nejběžnější bílkoviny se zcela neznámou funkcí,které mají homology v geneticky manipulovatelných prvocích. Navázáním tagu tyto bílkoviny označíme a určíme tím jejich buněčnou lokalizaci a vazebné partnery. Vybrané geny budou v příslušných prvocích vypnuty a následná fenotypická analýza umožní určit jejich funkce.Zaměříme se na bílkoviny tvořící kinetochory a cytoplasmatické a mitochondriální ribozomy,které dosud nebyly studovány u skupin představujících víc než polovinu eukaryotické diverzity.Prostřednictvím velké knihovny monoklonálních protilátek a dalšími přístupy budeme identifikovat dosud přehlížené skupiny prvoků,které jsou s vysokou pravděpodobností zásadní z evolučního hlediska a hrají důležité role v mořském ekosystému.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
OECD FORD - main branch
10601 - Cell biology
OECD FORD - secondary branch
10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
OECD FORD - another secondary branch
10608 - Biochemistry and molecular biology
CEP - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
CE - Biochemistry<br>EA - Morphology and cytology<br>EB - Genetics and molecular biology
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2023
Realization period - end
Dec 31, 2027
Project status
B - Running multi-year project
Latest support payment
Apr 9, 2024
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP25-GA0-GX-R
Data delivery date
Feb 21, 2025
Finance
Total approved costs
42,471 thou. CZK
Public financial support
42,471 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK