Systems of microfluidics and mass spectrometry for differential proteomic and metabolomic analysis of industrially important microorganisms
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
Výzkumné granty 5 (SAV02005-A)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
IAA400310506
Alternative language
Project name in Czech
Systémy mikrofluidiky a hmotnostní spektrometrie pro diferenciální proteomickou a metabolickou analýzu průmyslově významných mikroorganismů
Annotation in Czech
Budou vyvinuty miniaturizované systémy pro analýzu komplexních vzorků buněčných proteinů a metabolitů. Jejich použití při srovnávací analýze vybraných kmenů kvasinek (Saccharomyces cerevisiae, Rhodotorula glutinis, Xanthophyllomonas dendrorhous) kultivovaných v přítomnosti exogenních stresových faktorů umožní lepší pochopení průběhu a možností regulace metabolických procesů vedoucích k produkci průmyslově významných látek jako karotenoidů a sterolů. Navržené analytické systémy poskytnou efektivní řešeníanalytických problémů, které nebyly v této oblasti doposud spolehlivě vyřešení: 1) rychlou současnou kvantitativní analýzu a identifikaci analytů v komplexních směsích vzorků, 2) jednoduchou manipulaci, separaci, chemickou modifikaci a analýzu vzorků oobjemech od nl do ml, 3) přímé spojení mikrofluidického zařízení k hmotnostním spektrometrem. Za těchto předpokladů lze uskutečnit diferenciální proteomickou a metabolomickou analýzu výše uvedených mikroorganismů.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
CB - Analytical chemistry, separation
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10406 - Analytical chemistry
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Integrated miniaturized analytical systems for the differential proteomic and metabolomic analysis were developed and optimized. The genome, proteome and metabolome of important yeast cells grown under different exogenous stress conditions were analyzed.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2005
Realization period - end
Dec 31, 2008
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 21, 2008
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP09-AV0-IA-U/01:1
Data delivery date
Jul 2, 2009
Finance
Total approved costs
3,590 thou. CZK
Public financial support
3,590 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK