Study of structure, function and inhibition of retroviral integrase and proteinase
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
—
Main participants
Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Studium funkce, struktury a inhibice retrovirové integrasy a proteinasy
Annotation in Czech
Integrasa a proteinasa jsou enzymy katalyzující klíčové procesy v replikačním cyklu retrovirů. Přestože je životní cyklus retrovirů podrobně studován, informace o procesu integrace provirové DNK do hostitelského genomu a způsob, jakým je aktivována retrovirová proteinasa, jsou limitované. Bude studován katalytický mechanismus, funkce, struktura a inhibicei intergrasy (IN) opičího viru (M-PMV). Gen kódující IN bude klonován do expresního vektoru. Po optimalizaci exprese v E. coli, bude IN isolovánaa jejíaktivity budou testovány in vitro.Pro studium struktury IN bude připravena řada mutantů a bude stanovena jejich aktivita. Série inhibitorů na bázi fosfonátových oligonukleotidů bude otestována s M-PMV integrasou. K objasnění mechanismu proteolýzy virových polyproteinů, budeme studovat autokatalycké vyštěpování proteinasy BLV (virus hovězí leukemie) z prekursorů proteinasy in vitro. Výsledky porovnáme s daty získanými pro M-PMV proteinasu.
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
Byly klonovány geny kódující integrasu a proteasu několika retrovirů do bakteriálních vektorů. Tyto enzymy byly isolovány, charakterizovány, byl studován jejich katalytický mechanismus a inhibice specifickými inhibitory, které by mohly blokovat infekci.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 1999
Realization period - end
Jan 1, 2001
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/2002/AV0/AV02IA/U/N/7:3
Data delivery date
Jan 15, 2007
Finance
Total approved costs
8,099 thou. CZK
Public financial support
1,959 thou. CZK
Other public sources
3,684 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK