Mutational analysis of structure-specific DNA-binding HMG-box B motif of nonhistone chromosomal protein HMG1
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
—
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
—
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Mutační analýza chromozomálního HMG1-box B motifu specifického pro různé struktury DNA
Annotation in Czech
HMG (high mobility group) doména byla nedávno identifikovaná jako nový DNA-vazebný motif vyskytující se v celé řadě DNA-vazebných proteinů a transkripčních faktorů. HMG1 je bílkovina asociovaná s chromatinem a obsahuje dvě HMG-box domény (A a B) vykazující značnou selektivitu k ohnuté DNA. V předkládaném grantu jsme navrhli mutační analýzu více než 15 amino kyselinových zbytků HMG1-box domény B podle jejich pravděpodobného významu odvozeného ze srovnání sekvencí HMG box domén evolučně distantních organismů (jako např. kvasinek, ryb, ptáků a savců) a nedávno publikované NMR struktury krysího HMG1-boxu B. Rekombinantní nativní a mutantní krysí HMG1-boxy B (syntetizované v E. coli) budou využity v in vitro vazebných experimentech s ohnutou DNA (modifikovanou protinádorově aktivním léčivem cisplatinou) a křížovými strukturami DNA (angl. four-way junctions) a rovněž pro studium vlivu mutantních HMG1-boxů B na ohýbání, smyčkování a superspiralizaci DNA.
Scientific branches
R&D category
—
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
EE - Microbiology, virology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
Byly identifikovány aminokyseliny N-terminální sekvence B-domény proteinu HMG1 nezbytné pro rozpoznání ohnuté DNA (lyzin96/arginin97) a indukcí ohybu DNA (lyzin90).
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 1996
Realization period - end
Jan 1, 1998
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/1999/AV0/AV09IA/V/3:3
Data delivery date
—
Finance
Total approved costs
1,865 thou. CZK
Public financial support
1,462 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK