Unsual Conformations of Guanine-Rich DNA Fragments

Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
—
Main participants
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
Contest type
—
Contract ID
—

Project name in Czech
Neobvyklé konformace fragmentů DNA bohatých na guanin
Annotation in Czech
V eukaryontních genomech se frekventně vyskytují sekvenční motivy (G)n a (GA)n. In vitro tvoří modiv (G)n kvadruplexy, triplexy a neobvyklou strukturu mající rysy A-formy. Motiv (GA)n tvoří paralelní a antiparalelní duplexy obsahující páry GG, AA a GA. Pomocí CD spektroskopie, elektroforézy, počítačového modelování a dalších metod budou zkoumány fragmenty DNA obsahující různé varianty sekvenčních motivů (G)n a (GA)n s cílem odhalit zákonitosti jejich izomerizací do výše uvedených neobvyklých struktur včetně vlivu detailů jejich sekvence nukleotidů a podmínek v roztoku (pH, divalentní ionty, délka a koncentrace oligonukleotidů, atd.). Zvláštní pozornost bude věnována studiu okolností, za kterých tyto motivy preferují tvořit výše uvedené neobvyklé struktury před kanonickým duplexem s komplementárními sekvencemi bází.

R&D category
—
CEP classification - main branch
CE - Biochemistry
CEP - secondary branch
9F - 9
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods

Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP/1997/AV0/AV07IA/V/9:4
Data delivery date
—

Similar projects(10)