Gene ybxF, a newly identified member of the streptomycin operon of Bacillus subtilis
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
Výzkumné granty 2 (SAV02002-AB)
Main participants
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
—
Alternative language
Project name in Czech
Gen ybxF, nově identifikovaný člen streptomycinového operonu u Bacillus subtilis
Annotation in Czech
Streptomycinový (str) operon, jeden z nejvíce evolučně konservovaných operonů u prokaryotů, se u E. coli skládá ze čtyř "house-keeping" genů: rpsL, rpsG, fus a tufA. První dva geny kodují ribosomální bílkoviny S12 a S7, druhé dva elongační faktory EF-G aEF-Tu. Nedávno jsme prokázali, že str operon gram-positivníchj bakterií B. stearothermophilus a b. subtilis, nese na svém 5'konci ještě další gen, nazvaný ybxF. Jeho transkripce ovlivňuje expresi zbylých čtyř genů operonu. ybxF koduje v obou organismechprotein s dosud neznámou funkcí a podle údajů v databasích je tento gen přítgomen i v dalších gram-positivních bakteriích. Zcela ale chybí v bakteriích gram-negativních. V projektu se navrhuje provedení komplexní studie ybxF: 1) Bude připraven a charakterizován B. subtilis bez genu ybxF (ybxF knoc-out), 2) Budou určeny důsledky zvýšené produkce proteinu abxF pro transkripci a buňku, 3) Protein ybxF bude isolován, testován a krystalizován k určení 3D struktury.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EE - Microbiology, virology
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10606 - Microbiology<br>10607 - Virology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
N - Nesplněno zadání
Project results evaluation
The first gene of the streptomycin operon of Bacillus subtilis, called ybxF, is not an essential gene coding for a ribosomal protein of 82 amino acid residues. GreA protein inhibits activity of RNA polymerase initiating from rrn promoters in vitro.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2002
Realization period - end
Jan 1, 2005
Project status
U - Finished project
Latest support payment
—
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP06-AV0-IA-U/04:2
Data delivery date
Sep 26, 2007
Finance
Total approved costs
3,581 thou. CZK
Public financial support
2,327 thou. CZK
Other public sources
1,254 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK