Interaction of Bacillus subtilis rRNA promoters with RNA polymerase: Defining elements required for regulation
Public support
Provider
Czech Science Foundation
Programme
Post-graduate (doctorate) grants
Call for proposals
Postdoktorandské granty 5 (SGA02005GA1PD)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
204/05/P510
Alternative language
Project name in Czech
Interakce rRNA promotorů s RNA polymerázou u Bacillus subtilis: definování elementů důležitých pro regulaci
Annotation in Czech
V rychle rostoucí bakteriální kultuře, ribozomální RNA (rRNA) operony jsou zodpovědné až za 60% celkové transkripce. Vzhledem k této velké investici do rRNA transkripce, RNA polymeráza (RNAP) a rRNA promotory se musely vyvíjet společně, aby umožnily optimální syntézu rRNA. V živinami chudém prostředí tyto promotory dramaticky snižují svojí aktivitu. Poslední experimenty ukázaly, že v Bacillus subtilis, na rozdíl od Escherichia coli, ze které pochází většina našich znalostí o regulaci rRNA transkripce, rRNA promotorové jádro (-35, -10) integruje sílu promotoru i jeho regulaci. DNA elementy identifikované v E. coli jako důležité pro regulaci rRNA promotoru, konkrétně suboptimální 16 bp mezerník a GC-bohatá oblast mezi -10 a + 1, u B. subtilis zcela chybí. Navrhuji definovat DNA elementy zodpovědné za regulaci rRNA promotorů v gram-pozitivní bakterii B. subtilis. Následně bych chtěl určit interakce těchto elementů s RNAP. Tento přístup by měl umožnit nejen lepší pochopení
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
—
CEP - another secondary branch
—
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
U - Uspěl podle zadání (s publikovanými či patentovanými výsledky atd.)
Project results evaluation
The goal of the research was to define elements important for regulation of rRNA promoters by initiating nucleoside triphosphates in Bacillus subtilis. This goal has been reached. The outcome of the research can be divided into two projects: (i) DNA dete
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2005
Realization period - end
Dec 31, 2007
Project status
U - Finished project
Latest support payment
May 2, 2007
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP08-GA0-GP-U/03:2
Data delivery date
Oct 17, 2008
Finance
Total approved costs
1,174 thou. CZK
Public financial support
1,174 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK