Chromosome evolution in crucifers (Brassicaceae) revealed by comparative chromosome painting
Public support
Provider
Academy of Sciences of the Czech Republic
Programme
Grants of distinctly investigative character focused on the sphere of research pursued at present particularly in the Academy of Sciences of the Czech Republic
Call for proposals
Výzkumné granty 9 (SAV02009-A)
Main participants
—
Contest type
VS - Public tender
Contract ID
IAA601630902
Alternative language
Project name in Czech
Evoluce chromosomů brukvovitých (Brassicaceae) analyzována pomocí komparativního chromosomálního paintingu
Annotation in Czech
Technika komparativního chromosomálního paintingu (KCP), umožňující identifikaci rozsáhlých homeologických chromosomálních úseků sdílených dvěmi nebo více druhy, je u rostlin aplikovatelná pouze v čeledi Brassicaceae (brukvovité). Tento projekt prohloubíznalosti o rozsahu mezidruhové chromosomální kolinearity, způsobech a rychlosti karyotypových změn u rostlin. Evoluce karyotypu bude studována ve vztahu k Ancestrálnímu Karyotypu Brukvovitých (ACK) a ancestrálním genomickým blokům. Poprvé bude pomocí KCP podrobně analyzována vnitrorodová a vnitrodruhová variabilita karyotypu. Porovnání unikátních výsledků KCP analýz s fylogenetickými vztahy v čel. Brassicaceae výrazně přispěje k pochopení role chromosomálních změn v genetické diversifikaci a speciaci vrostlinné říši.
Scientific branches
R&D category
ZV - Basic research
CEP classification - main branch
EB - Genetics and molecular biology
CEP - secondary branch
EA - Morphology and cytology
CEP - another secondary branch
EF - Botany
OECD FORD - equivalent branches <br>(according to the <a href="http://www.vyzkum.cz/storage/att/E6EF7938F0E854BAE520AC119FB22E8D/Prevodnik_oboru_Frascati.pdf">converter</a>)
10601 - Cell biology<br>10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology<br>10603 - Genetics and heredity (medical genetics to be 3)<br>10604 - Reproductive biology (medical aspects to be 3)<br>10605 - Developmental biology<br>10608 - Biochemistry and molecular biology<br>10609 - Biochemical research methods<br>10611 - Plant sciences, botany<br>10612 - Mycology<br>30101 - Human genetics
Completed project evaluation
Provider evaluation
V - Vynikající výsledky projektu (s mezinárodním významem atd.)
Project results evaluation
New data on the extent of inter-species chromosome collinearity and karyotype evolution in crucifers were obtained using the method of comparative chromosome painting. New ancestral genomes and whole-genome duplication events were characterized.
Solution timeline
Realization period - beginning
Jan 1, 2009
Realization period - end
Dec 31, 2012
Project status
U - Finished project
Latest support payment
Feb 29, 2012
Data delivery to CEP
Confidentiality
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Data delivery code
CEP13-AV0-IA-U/02:2
Data delivery date
Feb 12, 2014
Finance
Total approved costs
4,126 thou. CZK
Public financial support
4,126 thou. CZK
Other public sources
0 thou. CZK
Non public and foreign sources
0 thou. CZK